Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  27  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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14
8
0
76
1.01
7841756--7841811
28
1.9
30
82
7
71
10
10
0
78
0.96
7842370--7842413
23
2.0
23
86
8
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27
13
6
52
1.66
7842725--7842759
16
2.3
15
90
5
52
31
2
2
62
1.24
7854570--7855173
74
8.7
71
83
11
706
31
17
20
31
1.95
7854761--7855178
145
2.9
145
87
6
591
31
16
19
32
1.95
7856018--7856090
24
3.0
25
90
7
114
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27
2
4
1.24
7856018--7856089
26
3.0
24
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9
119
65
27
2
4
1.25
7856299--7856340
14
3.2
13
87
9
59
14
9
0
76
1.02
7856891--7856933
23
2.0
23
86
9
63
27
13
6
51
1.67
7858657--7858683
14
1.9
14
100
0
54
40
29
7
22
1.81
7858700--7858749
20
2.5
20
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0
73
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18
1.74
7860325--7860365
19
2.2
18
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60
2
2
34
1.23
7860567--7860640
31
2.4
31
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4
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44
10
13
31
1.78
7860513--7860697
89
2.1
88
81
8
207
52
10
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25
1.69
7864206--7864245
20
2.0
20
85
4
55
45
0
0
55
0.99
7870835--7870880
21
2.2
21
88
0
65
8
30
36
23
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2
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0
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0
48
0
1.00
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44
7.7
44
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9
174
29
16
26
27
1.97
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89
3.8
86
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13
210
30
15
27
26
1.96
7890068--7890523
44
10.3
43
67
16
164
30
19
22
26
1.98
7890358--7890523
43
3.8
43
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10
160
30
19
22
28
1.98
7890965--7891019
19
2.8
19
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2
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18
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3
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1.11
7891540--7891636
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13
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1.32
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15
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0
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1.32
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3
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3
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10
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3
1
62
1.20
7891757--7891910
58
2.6
59
80
14
187
33
3
1
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1.23
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3.0
28
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13
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2
3
1.28
7893891--7893936
15
3.4
14
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11
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13
8
0
78
0.97
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15
2.3
15
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0
50
32
2
2
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1.26
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72
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16
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31
1.95
7906685--7907307
222
2.8
218
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2
1012
30
16
21
31
1.95
7906684--7907307
294
2.1
292
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2
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30
16
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31
1.95
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27
2.7
26
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35
2
5
1.38
7908185--7908243
27
2.1
28
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75
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25
3
5
1.28
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13
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0
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0
0
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2.0
23
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27
13
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51
1.67
7909428--7909462
16
2.3
15
90
5
52
31
2
2
62
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7913048--7913125
17
4.5
17
72
12
52
71
2
1
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1.06
7914933--7914966
4
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4
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0
50
20
0
5
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1.04
7915107--7915132
13
2.0
13
100
0
52
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7
0
23
1.14
7915186--7915242
28
2.0
28
100
0
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47
14
17
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7916736--7916805
30
2.4
28
85
4
95
58
5
4
31
1.41
7917781--7917814
14
2.4
14
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0
50
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0
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7918289--7918323
17
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2.1
35
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0
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3.8
46
77
7
207
28
27
20
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373