Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  297  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100780633--100780662
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14
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20
21
21
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1.9
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2
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15
0
34
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10.4
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19
116
41
1
3
53
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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0
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2.0
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0
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0
0
58
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2
0
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2
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1.81
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13
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3.2
34
63
15
85
44
14
17
23
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100919745--100919834
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53
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22
1.68
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2.2
24
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0
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56
9
13
20
1.64
100920415--100920485
31
2.3
30
83
9
90
22
11
19
46
1.81
100921138--100921200
32
2.0
32
87
3
92
30
1
1
66
1.10
100921143--100921213
32
2.3
30
80
9
81
30
0
1
67
0.99
100921144--100921213
31
2.3
30
79
13
79
30
0
1
68
0.98
100923148--100923264
59
2.0
59
91
3
191
34
4
6
54
1.46
100926159--100926201
23
1.9
22
95
4
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48
11
0
39
1.40
100926160--100926211
23
2.3
22
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12
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50
11
0
38
1.39
100927868--100927915
26
1.9
26
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29
0
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1.24
100931359--100931420
29
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29
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0
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30
16
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7
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7
92
0
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12
3
0
0.74
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6
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13
2
2
81
0.90
100938684--100938726
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2.6
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9
6
1.15
100939064--100939166
43
2.4
43
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0
125
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17
18
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21
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21
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0
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27
2.0
27
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7
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65
14
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100950672--100950702
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1.81
100951070--100951102
15
2.1
16
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36
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1.66
100952261--100952298
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2.2
18
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15
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1.83
100953493--100953551
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19.7
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96
0
109
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0
30
0
0.89
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18
2.2
17
86
9
51
21
7
2
68
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100965699--100965752
22
2.3
24
78
9
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33
1
9
55
1.42
100971844--100971894
25
2.0
26
92
3
86
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3
7
41
1.51
100972063--100972117
9
6.1
9
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23
32
0
43
1.54
100972059--100972115
18
3.2
18
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26
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0
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0
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0
0
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1.8
131
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36
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13
34
1.87
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6
6
0.82
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0
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1.00
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1.9
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2.7
143
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25
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2.7
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2
236
17
23
23
35
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27
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27
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11
175
18
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22
35
1.96
100986719--100986877
81
2.0
80
83
10
200
18
23
22
35
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5.1
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19
23
21
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100993816--100993962
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2
224
19
24
21
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100993829--100993976
27
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144
20
25
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0
0
17
0.66
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7
8.8
8
72
19
50
63
1
0
34
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101004397--101004453
22
2.6
22
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63
1
0
35
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24
2.7
24
80
9
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56
0
1
42
1.09
101004604--101004669
23
2.8
24
78
17
68
56
0
1
42
1.08
101004822--101004869
21
2.3
21
78
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2
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0
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0
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101007380--101007427
19
2.6
18
86
3
60
41
2
2
54
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373