Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  40  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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2.0
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
11657258--11657360
38
2.7
37
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100
30
21
28
20
1.98
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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595
29
21
13
34
1.92
11685645--11685790
49
3.0
49
88
1
211
32
30
15
22
1.94
11687044--11687189
37
4.0
37
91
1
233
24
22
16
36
1.94
11687153--11687519
46
7.6
46
83
10
428
29
22
13
34
1.92
11687242--11687275
7
4.7
7
88
3
50
26
26
2
44
1.69
11687196--11687517
52
6.4
52
83
9
407
29
22
12
34
1.91
11687164--11687519
98
3.6
98
94
0
586
29
21
13
34
1.92
11693176--11693214
11
3.5
11
96
0
69
23
30
0
46
1.53
11694882--11694946
30
2.2
30
88
0
94
29
44
18
7
1.77
11695003--11695040
18
2.1
18
95
0
67
23
26
10
39
1.87
11695532--11695593
9
6.6
9
75
17
63
33
3
1
61
1.22
11695491--11695648
86
1.8
86
94
0
280
37
3
4
54
1.36
11695619--11695648
9
3.4
9
90
9
53
36
0
0
63
0.95
11695496--11695675
86
2.1
86
82
3
211
41
3
4
50
1.41
11698678--11699434
126
6.1
126
86
5
992
30
16
16
36
1.91
11699018--11699359
113
2.9
117
80
11
369
30
17
15
36
1.91
11698892--11699358
239
2.0
238
87
1
675
30
17
15
36
1.91
11699131--11699436
125
2.4
125
90
2
472
33
17
13
35
1.89
11699640--11699691
21
2.5
21
81
3
70
44
32
1
21
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11702052--11702094
21
2.0
21
95
0
77
27
0
37
34
1.57
11702075--11702107
16
2.1
16
94
0
57
33
0
36
30
1.58
11702086--11702180
45
2.1
44
88
1
136
34
5
27
32
1.79
11702342--11702376
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
11702300--11702372
27
2.7
27
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8
76
52
2
0
45
1.15
11702261--11702532
144
1.9
147
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3
478
46
2
2
47
1.32
11702486--11702520
18
2.0
18
88
5
54
54
0
0
45
0.99
11702501--11702688
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3.1
61
67
14
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49
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2
42
1.40
11702469--11702691
120
1.9
120
96
0
410
49
5
2
42
1.39
11702606--11702640
18
2.0
17
88
5
52
60
0
0
40
0.97
11702681--11702727
17
2.9
16
78
18
53
46
2
6
44
1.40
11702700--11702733
17
2.0
17
94
0
59
50
0
5
44
1.26
11702766--11702960
93
2.1
92
88
4
286
47
4
4
44
1.41
11711753--11711786
17
2.0
17
88
11
52
82
5
2
8
0.93
11722573--11724240
870
1.9
872
83
6
2157
35
14
22
27
1.94
11725525--11726493
483
2.0
483
89
3
1499
36
15
24
24
1.94
11734170--11734494
160
2.0
162
92
1
546
30
18
15
35
1.92
11740740--11740859
31
3.8
31
83
1
141
30
14
20
35
1.92
11762525--11762788
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6.6
40
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257
25
20
27
26
1.99
11762642--11762822
79
2.3
80
80
3
197
27
19
27
25
1.99
11766507--11766547
19
2.2
19
86
4
57
70
4
2
21
1.18
11766473--11766546
31
2.4
31
78
13
82
66
4
2
27
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11771905--11771945
21
1.9
21
90
5
64
39
2
4
53
1.35
11771954--11772030
8
10.1
8
82
16
74
25
0
0
74
0.83
11771960--11772021
15
4.3
14
78
11
63
27
0
0
72
0.85
11771954--11772030
23
3.4
23
81
12
79
25
0
0
74
0.83
11771954--11772030
37
2.1
38
87
2
111
25
0
0
74
0.83
11771968--11772022
14
3.8
14
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9
74
27
0
0
72
0.85
11771957--11772030
30
2.5
29
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4
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25
0
0
74
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11772099--11772146
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2.1
23
100
0
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2.0
37
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5
121
20
0
28
50
1.48
11772863--11773124
41
6.4
41
88
2
332
21
25
20
31
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373