Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  335  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
Size
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Indices
Period
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Period
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1.30
112453419--112453461
8
4.8
9
81
18
54
46
0
9
44
1.35
112462770--112462794
13
1.9
13
100
0
50
12
32
40
16
1.84
112466114--112466186
38
1.9
38
94
0
128
27
21
30
20
1.98
112472201--112472275
28
2.8
25
75
13
69
60
1
2
36
1.20
112472190--112472273
18
4.8
17
68
17
55
60
1
3
34
1.21
112472635--112472686
18
2.8
18
86
13
63
34
0
0
65
0.93
112479968--112480136
43
3.9
44
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2
218
12
22
33
31
1.91
112485029--112485073
20
2.3
20
80
3
56
13
0
6
80
0.91
112486059--112486101
17
2.5
17
85
14
61
79
9
6
4
1.06
112491753--112491893
72
2.0
72
91
0
228
34
17
25
21
1.96
112493773--112494968
146
8.1
149
85
7
1473
29
7
6
56
1.52
112493773--112494968
303
4.0
299
88
5
1620
29
7
6
56
1.52
112494496--112494529
12
2.7
13
86
4
52
20
0
2
76
0.92
112493773--112494818
449
2.3
441
89
5
1603
28
7
6
56
1.52
112494676--112494954
135
2.1
137
86
2
384
29
7
6
56
1.52
112495530--112495589
10
6.1
10
72
18
54
1
28
0
70
0.97
112495771--112495816
18
2.4
20
86
13
62
4
8
8
78
1.09
112495878--112496016
70
2.0
70
98
0
269
28
15
9
46
1.76
112496281--112496328
25
1.9
25
91
8
80
37
20
0
41
1.53
112496281--112496336
25
2.2
25
87
6
78
39
19
1
39
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112500600--112500625
8
3.2
8
100
0
52
23
11
0
65
1.25
112501960--112502023
28
2.4
27
82
12
78
50
14
1
34
1.52
112508668--112508826
27
5.9
27
84
5
182
33
21
25
19
1.97
112508668--112508829
54
3.0
54
91
2
247
33
21
25
19
1.97
112509221--112509250
8
3.8
8
95
0
51
6
23
26
43
1.78
112510430--112510511
26
3.2
26
94
0
137
36
23
7
32
1.82
112517294--112517614
93
3.4
92
80
12
370
21
29
19
29
1.98
112517294--112517635
47
7.3
45
72
13
246
21
29
20
29
1.98
112517294--112517635
187
1.8
184
84
8
467
21
29
20
29
1.98
112520027--112520058
13
2.5
13
94
0
55
9
34
37
18
1.83
112520473--112520510
14
2.9
13
81
11
51
57
10
13
18
1.63
112529303--112529371
34
2.0
34
97
0
129
26
21
11
40
1.87
112536372--112536437
19
3.2
21
87
6
64
34
19
9
36
1.84
112536389--112536486
19
5.2
19
90
7
155
34
16
10
38
1.82
112536389--112536486
36
2.6
37
88
9
144
34
16
10
38
1.82
112550629--112550812
40
4.7
40
79
11
177
26
22
26
24
2.00
112550629--112550812
79
2.3
81
81
11
204
26
22
26
24
2.00
112550681--112550845
79
2.1
79
80
8
176
27
21
26
24
1.99
112558549--112558732
40
4.6
41
80
12
199
25
22
27
24
2.00
112558549--112558732
79
2.3
81
81
11
213
25
22
27
24
2.00
112558601--112558765
79
2.1
79
81
8
185
26
21
27
24
1.99
112571346--112571383
14
2.9
13
81
11
51
57
10
13
18
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112595986--112596156
43
4.0
43
75
11
170
32
23
17
26
1.97
112597789--112597918
48
2.7
48
86
4
190
22
16
26
34
1.95
112600914--112600949
17
2.1
17
89
0
54
55
16
0
27
1.42
112601790--112601847
21
2.7
22
81
10
66
13
25
37
22
1.91
112605235--112605287
28
1.9
27
88
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79
56
13
5
24
1.58
112608409--112608454
19
2.4
19
92
0
74
30
17
26
26
1.97
112624398--112624569
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1.8
93
91
2
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28
29
20
21
1.98
112624390--112624565
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3.8
46
78
10
187
29
28
19
21
1.98
112632975--112633107
3
43.7
3
72
8
81
29
7
1
61
1.32
112632987--112633107
12
9.8
12
77
10
109
29
8
1
60
1.36

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373