Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  12  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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112
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33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
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2.7
28
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145
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23.3
3
71
8
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5
2
30
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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2
17
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3729156--3729189
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2.3
15
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23
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12
39
16
1.85
3772995--3773045
24
2.1
25
96
3
95
43
11
25
19
1.85
3772993--3773052
24
2.7
21
80
16
75
41
15
23
20
1.89
3774294--3774321
13
2.2
13
100
0
56
50
21
7
21
1.72
3781520--3781549
12
2.5
12
94
0
51
53
10
26
10
1.66
3782558--3782623
34
1.9
34
100
0
132
27
22
21
28
1.99
3787851--3787884
16
2.2
15
89
5
50
41
0
0
58
0.98
3790258--3790309
20
2.5
20
87
3
68
65
5
17
11
1.44
3797066--3797114
20
2.5
20
76
6
55
63
0
4
32
1.13
3803295--3803328
3
11.3
3
100
0
68
0
64
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10
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10
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0
1
28
0.98
3803536--3803596
30
2.0
30
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67
0
1
31
1.01
3803543--3803667
19
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18
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14
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65
0
1
32
1.08
3803538--3803685
9
15.7
9
72
14
84
65
0
1
32
1.06
3803550--3803696
19
7.3
20
66
17
63
64
0
1
33
1.07
3804486--3804548
30
2.1
30
82
5
74
53
0
3
42
1.16
3812444--3812529
35
2.4
36
90
5
129
60
1
2
36
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3812471--3812529
18
3.3
18
69
2
57
64
0
3
32
1.10
3812473--3812529
17
3.3
17
68
4
51
64
0
3
31
1.10
3814975--3815004
11
2.7
11
89
0
51
86
0
13
0
0.57
3814975--3815008
15
2.4
14
90
5
50
85
0
14
0
0.60
3814975--3815008
7
4.7
7
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7
50
85
0
14
0
0.60
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2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
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3
10.3
3
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0
53
0
29
0
70
0.87
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11
2.8
12
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9
57
75
0
0
25
0.81
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22
2.3
22
83
10
59
56
6
8
30
1.52
3838661--3838733
36
2.0
36
97
0
137
39
5
6
47
1.53
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21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
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3
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3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
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21
2.2
21
80
3
58
67
0
0
32
0.91
3859377--3859417
17
2.7
15
82
17
57
63
0
0
36
0.95
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8
3.2
8
100
0
52
53
0
0
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1.00
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29
2.2
29
83
8
76
37
6
10
45
1.65
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14
2.9
14
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0
53
35
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15
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1.75
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3.9
7
100
0
54
44
0
0
55
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19
2.5
20
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9
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33
0
3
62
1.13
3892928--3892969
6
7.0
6
84
7
50
33
0
4
61
1.17
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39
2.5
38
85
6
119
37
21
20
22
1.95
3900492--3900571
39
2.1
39
88
4
117
41
20
18
20
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3900629--3900907
41
6.8
41
92
1
436
29
23
21
25
1.99
3901198--3901346
7
20.3
7
66
11
57
24
1
28
46
1.61
3901253--3901310
22
2.6
22
77
0
62
22
0
31
46
1.52
3901273--3901307
15
2.4
14
90
4
52
17
0
37
45
1.48
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44
2.1
43
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9
107
25
2
34
38
1.68
3901692--3901745
16
3.8
16
70
27
57
38
9
3
48
1.53
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2.1
16
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50
30
0
0
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2.1
15
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50
13
0
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1.42
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4.3
40
83
0
198
25
30
21
23
1.99
3906532--3906703
80
2.2
80
84
1
229
25
30
20
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373