Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  336  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
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Score
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Indices
Period
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Copy
Number
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Period
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21
2.0
21
81
9
50
7
19
54
19
1.66
112792723--112792791
30
2.4
26
78
19
75
55
1
7
36
1.37
112807557--112807600
22
2.0
22
82
8
54
65
2
2
29
1.16
112807586--112807672
39
2.2
38
82
8
104
67
3
1
27
1.13
112807558--112807661
49
2.2
47
83
10
122
68
2
1
26
1.14
112807588--112807674
10
9.0
9
72
19
52
68
3
1
26
1.12
112807623--112807698
10
7.5
10
73
19
52
57
1
1
39
1.15
112807623--112807698
11
7.5
11
73
19
51
57
1
1
39
1.15
112808138--112808214
30
2.5
31
81
6
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42
9
15
32
1.78
112808737--112808999
126
2.1
125
87
2
375
41
13
17
26
1.87
112809264--112809320
25
2.3
23
80
14
60
63
1
1
33
1.15
112810338--112810385
25
2.0
24
84
12
62
72
2
6
18
1.15
112810338--112810388
24
2.1
23
82
13
59
74
1
5
17
1.11
112817294--112817356
24
2.6
25
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7
76
74
6
6
12
1.20
112819156--112819185
13
2.2
14
94
5
53
43
6
50
0
1.28
112829090--112829183
46
2.0
46
100
0
188
32
21
12
32
1.91
112830016--112830079
21
3.0
21
81
0
83
42
17
3
37
1.65
112833228--112833337
26
4.2
26
94
2
177
34
4
24
36
1.76
112834779--112834853
26
2.8
26
85
4
87
34
22
12
30
1.91
112834955--112835085
54
2.4
54
93
1
217
19
25
22
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112834958--112835117
27
5.9
27
78
12
159
20
23
21
34
1.97
112834962--112835117
81
1.9
81
83
7
201
21
23
20
34
1.97
112837159--112837205
24
2.0
24
83
8
60
21
21
27
29
1.98
112839088--112839197
26
4.2
26
94
2
177
34
4
24
36
1.76
112840639--112840713
26
2.8
26
85
4
87
34
22
12
30
1.91
112840818--112840949
27
4.9
25
82
10
147
20
25
21
33
1.97
112840815--112840953
54
2.6
54
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3
219
20
24
20
33
1.97
112840818--112840977
27
5.9
27
77
14
134
21
24
20
33
1.97
112840819--112840976
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2.0
81
82
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196
21
24
20
34
1.97
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2.1
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13
109
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13
28
1.94
112842730--112842838
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2.4
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10
136
30
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16
26
1.97
112842739--112843059
177
1.8
177
90
1
518
29
23
18
28
1.98
112843175--112843199
13
1.9
13
100
0
50
32
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24
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1.84
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18
2.1
18
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23
41
23
12
1.88
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176
3.5
176
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1
952
27
24
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29
1.98
112847292--112847408
44
2.7
44
80
7
114
28
23
19
28
1.99
112847295--112847498
45
4.6
45
82
3
198
27
20
19
32
1.97
112847340--112847498
45
3.6
45
88
0
212
27
18
18
34
1.95
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64
2.0
64
92
0
211
38
14
15
31
1.88
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13
1.9
13
100
0
50
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0
0
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3.9
8
100
0
62
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0
22
38
1.54
112856443--112856469
13
2.1
13
100
0
54
14
29
33
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112873531--112873577
15
3.3
14
79
11
51
68
2
6
23
1.24
112875808--112876364
138
4.0
138
89
0
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5
8
40
1.59
112876340--112876559
78
2.8
78
92
2
343
33
13
6
46
1.69
112879429--112879794
48
7.6
48
78
7
350
30
19
28
22
1.98
112879466--112879701
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2.5
96
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1
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19
27
22
1.98
112879432--112879794
144
2.5
144
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1
442
30
19
28
22
1.98
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100
0
100
28
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0
115
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20
3.1
19
86
9
84
30
0
3
66
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373