Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  84  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Indels
Score
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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20
28
22
1.99
Indices
Period
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A
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(0-2)
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29
1.68
26654467--26654629
43
3.8
42
76
7
141
27
17
24
30
1.97
26656779--26656958
55
3.3
54
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3
279
31
28
13
26
1.94
26656779--26656958
28
6.6
27
93
2
279
31
28
13
26
1.94
26656781--26656958
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82
91
1
284
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0
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0
0
59
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0
0
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0
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0
0
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0
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3
3
25
1.18
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1.96
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30
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214
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43
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16
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2.4
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25
1.92
26693210--26693324
27
4.3
27
85
3
142
21
21
20
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.8
46
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24
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0
100
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6
26.8
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20
1.79
26724991--26725152
30
5.4
30
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2
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49
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20
1.79
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2.7
60
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1.79
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1.96
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54
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1.95
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2.1
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81
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17
20
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1.95
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2.2
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3
186
29
11
21
38
1.88
26726070--26726274
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2.5
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5
220
29
9
21
39
1.85
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14
2.0
15
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27
0
20
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1.47
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2.1
27
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2.1
15
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0
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27
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1.96
26736912--26737100
27
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4
186
29
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9
19
41
1.83
26736913--26737180
54
5.0
52
81
9
197
30
9
19
41
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26736917--26737181
27
9.9
27
79
9
147
30
9
19
41
1.83
26743370--26743398
14
2.0
15
93
6
51
27
0
20
51
1.47
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15
2.1
15
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0
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54
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2.7
28
85
0
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28
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22
1.96
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2.0
25
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0
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10
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1.90
26751240--26751279
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21
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0
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1.94
26759157--26759196
21
1.9
21
94
0
71
35
20
15
30
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373