Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  326  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109504387--109504460
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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38
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38
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1.54
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41
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3
228
27
27
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
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20
28
24
1.99
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2.4
96
86
1
311
25
19
29
25
1.99
109642269--109642589
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2.2
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380
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20
28
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1.99
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20
23
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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11
2
0.68
109720189--109720283
39
2.4
39
77
3
93
31
16
31
20
1.95
109727238--109727284
10
4.6
10
80
12
51
63
0
2
34
1.06
109732247--109732318
25
2.9
25
72
14
67
63
2
2
30
1.22
109734059--109734100
19
2.2
20
95
4
77
33
11
9
45
1.73
109734852--109734885
16
2.1
17
88
5
52
32
26
0
41
1.56
109735943--109735972
10
3.1
10
95
4
53
40
30
0
30
1.57
109756677--109756748
34
2.2
33
85
7
92
33
22
22
22
1.97
109761986--109762043
30
1.9
30
92
0
98
15
22
41
20
1.90
109769264--109769408
49
3.0
49
73
6
123
26
20
23
28
1.99
109774644--109774743
42
2.4
42
77
5
112
31
21
21
27
1.98
109779668--109779846
46
3.9
46
72
9
132
30
26
20
22
1.98
109789940--109789965
13
2.0
13
100
0
52
15
30
38
15
1.88
109792294--109792382
40
2.3
39
80
9
92
30
24
14
30
1.95
109798942--109799166
49
4.6
48
81
10
235
28
19
28
24
1.98
109798942--109799122
98
1.9
97
90
3
292
27
20
28
23
1.99
109816959--109817112
43
3.6
43
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1
166
31
22
15
31
1.95
109824441--109824519
39
2.0
39
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0
140
53
5
22
18
1.64
109826059--109826166
44
2.5
42
82
10
121
36
23
16
24
1.94
109830287--109830346
27
2.2
27
82
5
77
38
10
10
41
1.72
109830302--109830559
27
9.6
27
82
6
294
31
10
19
38
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109837263--109837444
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1.9
94
92
1
303
28
18
25
27
1.98
109837263--109837479
48
4.6
48
86
3
296
27
17
25
28
1.98
109837432--109837522
42
2.2
42
82
7
105
27
18
23
30
1.98
109843822--109843996
46
3.8
45
78
7
181
29
27
20
22
1.99
109843830--109844001
93
1.8
93
89
0
272
28
27
20
22
1.99
109843873--109844016
46
3.1
46
70
19
118
30
26
19
23
1.98
109846463--109846724
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5.5
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1
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29
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24
28
1.98
109862347--109862381
6
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100
0
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0
0
48
1.00
109864118--109864333
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2.3
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1
272
29
19
27
23
1.99
109864118--109864476
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7.7
47
70
12
184
28
19
27
23
1.98
109864162--109864481
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29
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28
22
1.98
109871293--109871534
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5.0
48
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2
297
30
20
25
23
1.98
109871293--109871616
48
6.9
48
78
8
224
28
20
25
25
1.99
109875380--109875526
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43
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14
122
32
11
25
30
1.91
109880669--109880900
48
4.8
48
81
0
257
31
19
23
25
1.98
109880669--109880897
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2.4
97
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1
300
31
19
23
25
1.98
109880669--109880993
48
6.9
48
74
8
209
28
20
24
26
1.99
109884203--109884469
47
5.7
47
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0
417
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29
26
1.93
109884172--109884483
94
3.3
94
89
0
464
31
11
29
27
1.91
109884220--109884293
23
3.2
23
62
24
55
28
10
29
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1.91
109884385--109884460
22
3.3
22
65
28
59
31
13
30
25
1.93
109884172--109884483
47
6.6
47
90
0
392
31
11
29
27
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109884477--109884567
46
2.0
46
82
4
112
34
6
32
26
1.82
109908243--109908322
42
1.9
42
89
0
124
31
21
20
27
1.98
109908856--109908909
29
1.9
28
81
7
65
27
24
1
46
1.63
109912060--109912245
80
2.3
80
83
9
220
27
27
21
23
1.99
109912062--109912245
40
4.6
40
83
7
196
27
27
21
23
1.99
109929887--109930160
27
10.2
27
86
5
281
40
22
8
27
1.83
109929887--109930198
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11.6
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5
191
40
23
8
26
1.84
109929887--109930198
107
2.9
108
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7
264
40
23
8
26
1.84
109930154--109930375
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223
37
18
18
25
1.93
109930156--109930377
54
4.1
54
84
1
275
36
19
18
25
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373