Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  56  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16792915--16793023
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4.2
26
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0
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23
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34
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4.2
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0
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25
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1.85
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2.0
613
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2.0
161
96
0
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16
16
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2.0
45
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0
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27
22
24
2.00
16819645--16819868
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1.9
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305
25
27
22
24
2.00
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3.5
35
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19
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10
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24
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2
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50
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47
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2.1
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0
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2.0
30
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2.0
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37
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2.0
41
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0
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1.58
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2.0
25
100
0
102
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19
0
31
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
63
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0
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1.9
24
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0
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1.32
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23
2.0
23
84
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45
10
6
36
1.65
16919012--16919056
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
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48
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6
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32
1.80
16924296--16924687
152
2.6
146
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4
624
36
6
25
31
1.81
16924296--16924684
98
3.9
98
88
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595
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25
31
1.81
16924834--16924942
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2.9
37
95
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191
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1.98
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2.1
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55
25
0
0
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23
0
0
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0.79
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2
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2.0
48
100
0
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10
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1.9
24
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70
4
14
10
1.31
16965692--16965802
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2.8
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20
26
28
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3.5
39
70
11
100
24
19
27
29
1.98
16965933--16965972
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2.2
18
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47
0
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30
1.52
16972222--16972268
25
1.9
24
86
4
67
70
2
14
12
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16973208--16973318
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20
26
28
1.99
16973208--16973342
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3.4
39
71
11
98
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20
27
28
1.99
16973445--16973485
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2.3
18
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48
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1.50
16974862--16974957
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133
34
4
13
47
1.62
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3.8
43
75
4
152
24
17
26
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28
28
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25
3.2
25
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35
5
26
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3.3
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16
10
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2.3
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16991286--16991489
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29
22
8
40
1.83
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27
75
11
139
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3.1
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1.81
16991468--16991634
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2.1
80
80
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20
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1.81
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2.4
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27
24
20
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1.99
16993172--16993311
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24
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1.99
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2.0
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24
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1.99
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15
23
25
1.94
16995335--16995372
15
2.5
15
100
0
76
21
15
34
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16996331--16996437
27
4.0
27
76
4
92
39
20
10
29
1.86
16996426--16996637
27
7.9
27
87
2
273
27
23
8
40
1.84
16996359--16996836
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17.6
27
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6
115
35
21
8
34
1.85
16996550--16996754
54
3.8
54
81
6
157
35
20
7
35
1.82
16996426--16996663
81
2.9
79
80
3
251
28
22
8
39
1.83
16996628--16996867
27
8.8
27
78
5
162
38
19
9
32
1.84
16996898--16996962
27
2.4
27
89
5
96
32
20
26
21
1.97
16997665--16997699
16
2.1
17
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17
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8
1.72
16998206--16998262
9
5.9
9
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15
51
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35
1.84
16998204--16998274
20
3.5
20
92
0
115
36
9
21
32
1.86
16998319--16998471
24
6.4
24
91
3
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29
22
20
26
1.99
16998319--16998471
47
3.2
47
88
5
236
29
22
20
26
1.99
16998319--16998471
71
2.1
71
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1
252
29
22
20
26
1.99
16998673--16998736
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
17001413--17001585
46
3.7
46
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14
194
22
20
27
29
1.99
17001410--17001580
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1.8
93
92
2
290
22
21
28
28
1.99
17003848--17003971
47
2.7
45
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24
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28
1.97
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0
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4
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1.44
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30
2.0
30
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0
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40
1.83
17044251--17044308
29
2.0
29
100
0
116
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13
1.87
17051962--17052090
50
2.7
48
85
10
158
24
29
18
27
1.98
17052108--17052229
46
2.6
47
84
6
142
22
30
18
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17051962--17052269
47
6.6
49
72
17
178
24
28
18
29
1.98
17052976--17053000
13
1.9
13
100
0
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4
16
1.44
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2.2
43
79
0
102
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21
18
22
1.95
17055436--17055572
42
3.3
42
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0
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16
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1.91
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0
1
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1.09
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2.8
40
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2
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29
18
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1.98
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2.0
37
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21
6
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1.78
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2
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1.31
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2.4
23
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28
0
5
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1.14
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2.2
13
100
0
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7
21
64
1.43
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13
100
0
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40
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14
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1
15
47
1.55
17074763--17074829
21
3.1
21
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1
16
47
1.56
17075267--17075296
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8
100
0
60
0
10
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0.47
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23
100
0
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18
38
1.70
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19
2.0
19
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25
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1.89
17088156--17088196
19
2.2
19
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0
64
21
36
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1.90
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15
3.5
15
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20
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50
22
2
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1.60
17088812--17088871
28
2.1
28
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0
111
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21
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1.57
17090777--17090835
30
1.9
30
89
3
91
30
13
13
42
1.83
17090933--17090966
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2.8
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100
0
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0
50
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19
2.3
19
92
0
70
45
2
2
50
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17103554--17103720
67
2.5
68
79
11
166
26
26
16
30
1.96
17106039--17106244
40
5.2
40
94
0
351
28
27
21
23
1.99
17108901--17109257
41
8.8
41
85
3
409
37
22
20
19
1.94
17108861--17109257
82
4.9
81
81
3
408
37
21
20
20
1.94
17108917--17109236
123
2.6
121
90
2
482
38
22
20
18
1.93
17109276--17109365
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2.4
38
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128
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33
0
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1.48
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7
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7
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1
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1
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0
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0
0
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0.90
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3
100
0
50
32
0
36
32
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373