Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  231  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1.9
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229
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15
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0
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62
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
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27
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23
1.99
78720885--78721032
40
3.7
40
94
0
251
21
27
20
30
1.98
78723824--78723883
13
4.8
12
74
10
57
66
1
3
28
1.17
78723823--78723884
6
9.8
6
75
15
54
66
1
3
29
1.17
78726500--78726760
47
5.6
47
92
1
389
32
12
28
26
1.92
78726469--78726780
94
3.3
94
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2
439
32
10
29
27
1.91
78726469--78726780
47
6.6
47
89
0
374
32
10
29
27
1.91
78726774--78726864
46
2.0
46
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4
112
34
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32
26
1.82
78729631--78729670
18
2.2
19
90
4
64
47
0
30
22
1.52
78734387--78734422
18
2.0
19
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78741036--78741078
21
2.1
21
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25
4
20
48
1.69
78746107--78746380
46
6.0
46
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0
388
41
13
23
21
1.89
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17
2.6
18
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10
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75
6
8
8
1.19
78752053--78752232
28
6.6
27
92
2
270
30
28
14
26
1.95
78752053--78752232
83
2.2
82
91
1
288
30
28
14
26
1.95
78752053--78752232
55
3.3
55
93
1
290
30
28
14
26
1.95
78754352--78754397
17
2.6
17
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13
58
60
0
36
2
1.09
78754352--78754399
8
5.5
8
79
16
51
60
0
37
2
1.09
78759105--78759334
49
4.6
50
81
2
266
26
17
26
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78780037--78780144
20
5.4
20
70
3
74
13
25
22
38
1.91
78783159--78783255
42
2.3
42
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3
115
42
25
4
27
1.73
78785452--78785856
47
8.6
47
95
1
675
28
29
8
33
1.86
78785502--78785580
25
3.3
25
66
16
76
31
29
5
34
1.79
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40
11.8
40
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0
746
25
28
21
24
1.99
78791765--78792169
47
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47
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1
639
29
29
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1.86
78791815--78791893
25
3.3
25
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16
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29
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34
1.79
78798564--78798655
28
3.3
28
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0
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29
1.92
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11.6
28
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10
313
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33
1.86
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26
4.9
26
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138
37
17
10
33
1.85
78799073--78799137
33
2.0
33
90
0
103
32
15
13
38
1.87
78798972--78799287
54
5.8
54
83
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345
37
18
11
33
1.86
78798972--78799330
27
13.1
27
76
11
116
37
16
11
34
1.85
78799311--78799387
27
2.9
27
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15
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27
0
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27
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27
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31
10
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1.90
78804800--78804911
28
4.0
27
83
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29
11
25
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1.91
78811282--78811310
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15
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27
0
20
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29
1.98
78817925--78817981
28
2.0
28
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0
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26
1.90
78817941--78818003
28
2.2
28
82
0
81
38
6
26
28
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78820993--78821164
50
3.6
48
81
12
185
28
16
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23
1.97
78823155--78823194
21
1.9
21
89
0
62
35
17
10
37
1.83
78824867--78825064
27
7.3
27
90
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290
29
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1.80
78825096--78825245
27
5.6
27
84
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176
43
20
6
29
1.77
78825176--78825305
27
4.7
27
70
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1.75
78826236--78826305
25
2.8
24
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25
24
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2.00
78826235--78826332
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17
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28
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78828955--78829151
27
7.3
27
86
2
254
27
24
8
39
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373