Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  302  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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264
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26
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2.00
102333731--102333955
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5.7
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26
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102333731--102333955
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23
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1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Score
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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74
1.06
102511224--102511305
5
15.6
5
72
14
58
20
3
2
73
1.11
102511224--102511266
11
3.8
12
80
20
56
18
4
0
76
0.95
102514541--102514571
16
1.9
16
93
0
53
51
0
9
38
1.35
102514537--102514601
28
2.3
27
76
10
67
40
0
10
49
1.38
102516418--102516453
18
2.0
18
100
0
72
16
38
11
33
1.84
102519192--102519303
41
2.6
42
80
8
120
27
20
24
27
1.99
102523452--102523505
3
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100
0
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33
0
0
66
0.92
102523654--102523695
16
2.7
16
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14
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42
0
0
57
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23
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13
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137
2.1
137
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538
31
24
19
25
1.98
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26
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0
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1.78
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7
3.9
7
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0
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0
29
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102545866--102545929
21
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20
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3
1
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1.20
102548728--102548942
46
4.6
48
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4
251
23
27
18
30
1.98
102548728--102548942
94
2.3
94
88
1
315
23
27
18
30
1.98
102551723--102551758
18
2.0
18
88
0
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1.91
102553010--102553067
25
2.3
25
100
0
116
13
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6
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1.68
102555269--102555366
46
2.3
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79
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32
5.0
32
91
0
266
32
12
10
45
1.75
102557641--102557800
64
2.5
64
95
0
293
32
12
10
45
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102559798--102559852
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2.6
21
88
0
83
30
36
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23
1.86
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48
2.1
48
83
3
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27
27
16
27
1.97
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2.2
18
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0
51
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2
0
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1.12
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18
1.9
18
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5
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2.0
27
85
0
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18
12
16
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1.74
102572472--102572526
27
2.0
27
89
0
83
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1.95
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2.2
60
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1.70
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2.0
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2105
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2.7
25
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21
24
22
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1.98
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26
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1.98
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2.0
22
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1.48
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2.0
23
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1.9
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0
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48
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5
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1.48
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2.1
57
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0
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18
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57
0
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1.9
121
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23
25
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29
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2.3
75
78
9
182
36
21
20
20
1.95
102627699--102627785
34
2.5
34
78
7
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31
26
20
21
1.98
102630095--102630124
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15
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73
0
26
0
0.84
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15
12.5
14
66
25
61
29
8
2
60
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102635739--102635919
3
61.3
3
76
8
115
27
7
2
62
1.36
102635823--102635853
16
1.9
16
93
0
53
22
16
3
58
1.52
102635831--102635908
25
3.3
25
75
17
76
24
6
5
64
1.38
102635855--102635926
37
1.9
38
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2
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25
5
2
66
1.27
102635833--102635917
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2.0
43
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0
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1.35
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16
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26
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2
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0
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28
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13
192
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28
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3.1
8
100
0
50
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0
0
16
0.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373