Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  291  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98728519--98728641
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30
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16
10
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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2.3
52
97
2
228
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3
35
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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(0-2)
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0
93
31
9
35
23
1.87
98959499--98959558
32
1.9
32
82
3
77
50
0
26
23
1.50
98961359--98961595
90
2.6
90
94
1
404
21
26
13
37
1.91
98962266--98962307
21
2.0
22
86
13
61
28
16
19
35
1.93
98966160--98966230
33
2.2
33
84
5
90
12
4
46
36
1.62
98967499--98967566
33
2.1
33
86
5
93
51
13
5
29
1.64
98968337--98968433
31
3.1
31
96
3
176
40
9
18
31
1.82
98970170--98970208
19
2.0
20
95
5
71
0
25
0
74
0.82
98970168--98970215
11
4.5
11
80
17
57
0
25
2
72
0.95
98974034--98974059
12
2.2
12
100
0
52
42
26
15
15
1.87
98977418--98977463
8
6.1
8
80
14
62
60
0
0
39
0.97
98977418--98977463
13
3.3
13
85
14
65
60
0
0
39
0.97
98977420--98977458
16
2.4
16
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0
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58
0
0
41
0.98
98978013--98978083
29
2.4
31
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39
2
9
47
1.51
98979089--98979143
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2.0
25
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13
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58
12
7
21
1.59
98982740--98982790
20
2.5
20
90
0
75
11
29
37
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1.89
98983319--98983355
13
2.8
13
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4
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54
18
0
27
1.44
98983687--98983783
40
2.5
39
80
8
110
30
26
24
17
1.97
98994977--98995041
21
3.2
21
73
20
75
40
26
24
9
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98994959--98995059
39
2.6
39
93
0
166
36
25
25
11
1.90
99006213--99006251
20
2.0
20
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10
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48
0
0
51
1.00
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17
2.2
18
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4
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44
23
0
31
1.54
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26
4.7
26
70
9
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24
23
20
31
1.98
99007943--99008119
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2.2
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1
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24
21
18
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1.96
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2.0
69
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0
243
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25
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1.80
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16
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0
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0
0
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0.94
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50
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177
26
17
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25
1.97
99016110--99016429
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15
191
27
18
29
24
1.98
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2.5
53
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2
189
27
17
26
28
1.97
99030225--99030375
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2.8
53
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4
205
25
15
28
29
1.96
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2.6
16
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72
2
2
22
1.07
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19
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70
6
4
17
1.26
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2.9
9
100
0
52
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0
0
11
0.52
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6
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0
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0
15
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0.82
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3
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12
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2.3
27
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0
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34
22
28
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1.93
99063726--99063835
28
3.9
28
83
4
132
28
14
30
27
1.95
99065582--99065651
19
3.2
24
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23
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44
2
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1.41
99065562--99065689
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3.1
42
94
1
213
43
2
8
45
1.47
99065558--99065628
19
3.6
19
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22
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47
1
7
43
1.39
99068846--99068965
61
2.1
57
84
9
154
43
4
3
49
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99071606--99071655
17
2.7
20
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18
70
10
0
44
46
1.37
99076245--99076294
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
99079720--99079768
21
2.3
21
82
10
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18
2
6
73
1.14
99082107--99082593
245
2.0
245
96
0
893
24
20
15
39
1.91
99093067--99093102
19
1.9
19
88
5
56
80
5
5
8
1.01
99093316--99093379
20
3.4
19
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14
62
14
0
17
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1.21
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2.2
13
100
0
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0
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1.29
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0
16
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1.29
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8
104
17
0
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68
1.22
99093388--99093445
26
2.3
26
88
8
86
37
5
8
48
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373