Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  306  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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1
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1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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26
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1.92
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Period
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Number
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Score
A
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25
16
40
1.89
103755849--103755873
11
2.3
11
100
0
50
48
0
0
52
1.00
103757774--103757913
53
2.6
53
88
2
201
29
27
17
25
1.98
103765261--103765406
53
2.7
53
88
4
195
30
27
15
27
1.96
103768348--103768531
50
3.7
50
85
3
246
28
26
18
26
1.98
103768348--103768531
101
1.8
99
88
2
278
28
26
18
26
1.98
103768674--103768708
13
2.7
13
95
0
61
65
0
2
31
1.07
103770676--103770725
24
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24
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0
100
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8
16
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103771912--103771974
30
2.1
30
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0
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3
12
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103772831--103772927
10
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10
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18
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59
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4
32
1.32
103772864--103772927
10
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10
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10
67
60
3
4
31
1.32
103772831--103772927
21
4.9
19
74
17
83
59
3
4
32
1.32
103781404--103781471
31
2.2
32
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10
97
22
8
22
47
1.78
103781540--103781629
20
4.4
20
73
8
65
54
1
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37
1.34
103783802--103783848
20
2.3
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0
6
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1.23
103784943--103785006
26
2.5
26
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50
1
3
45
1.27
103795554--103795663
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4.3
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39
10
16
34
1.82
103795554--103795663
52
2.1
52
93
1
186
39
10
16
34
1.82
103796876--103796969
41
2.4
39
78
13
97
51
2
3
43
1.29
103796912--103796990
31
2.6
31
76
13
83
48
5
2
44
1.38
103798657--103798687
16
1.9
16
93
0
53
70
9
9
9
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
67
81
8
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32
17
28
21
1.96
103801232--103801415
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
103810187--103810236
11
4.5
11
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0
55
22
14
6
58
1.58
103810828--103810870
21
2.0
21
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8
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0
4
48
1.22
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100
0
50
16
0
0
84
0.63
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40
2.1
40
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4
134
28
21
22
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1.99
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132
1.9
132
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352
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20
22
23
1.97
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2.2
40
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0
160
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1.97
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0
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1.9
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2.0
21
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0
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4
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2.2
26
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6
5
32
1.49
103815112--103815171
26
2.3
26
82
8
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55
6
5
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1.48
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3
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100
0
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0
0
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9
73
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6
5
32
1.49
103827882--103827941
26
2.3
26
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8
77
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6
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1.48
103828202--103828271
25
2.5
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20
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0
0
30
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103830269--103830320
7
7.0
7
87
12
77
71
1
0
26
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103830268--103830323
15
3.7
15
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2
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71
1
0
26
0.96
103830651--103830683
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1.9
17
100
0
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6
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1.47
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2.0
27
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0
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103834730--103834761
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2.1
15
100
0
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2.0
116
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1.97
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23
3.0
23
77
6
82
42
24
18
15
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373