Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  316  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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27
22
1.98
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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1.98
106837357--106837667
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3.0
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1.54
Indices
Period
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Copy
Number
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Score
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5.6
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1
31
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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22
1.89
106925762--106925798
20
1.9
20
88
5
58
40
0
8
51
1.32
106927959--106928232
46
6.0
46
88
0
343
39
15
24
20
1.91
106927959--106928232
92
3.0
92
87
0
395
39
15
24
20
1.91
106930626--106930680
28
2.0
28
88
0
83
12
34
25
27
1.92
106934385--106934418
6
5.8
6
86
6
52
0
17
0
82
0.67
106934385--106934418
11
2.9
12
86
8
52
0
17
0
82
0.67
106944549--106944829
149
1.9
150
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408
39
7
6
46
1.58
106945831--106945878
23
2.1
23
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14
64
33
8
4
54
1.50
106953749--106953844
40
2.5
39
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10
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14
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34
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106956129--106956349
49
4.6
48
74
9
195
24
27
20
27
1.99
106956227--106956398
94
1.8
93
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8
233
27
27
19
25
1.99
106956130--106956404
49
5.8
47
71
11
145
26
27
20
26
1.99
106958884--106958945
29
2.2
27
83
11
72
30
1
1
66
1.11
106958967--106959171
87
2.4
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5
200
35
20
10
33
1.87
106959370--106959423
20
2.7
20
77
11
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72
1
5
20
1.14
106959457--106959564
48
2.3
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1.42
106959718--106959898
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2.1
84
82
2
209
34
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1.76
106960422--106960460
15
2.5
16
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33
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1.79
106967577--106967648
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18
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7
85
31
18
13
36
1.90
106974444--106974492
25
2.0
25
91
0
80
38
18
4
38
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106977688--106977738
25
2.0
25
96
0
93
21
37
11
29
1.89
106979142--106979192
25
2.0
25
92
0
84
37
17
5
39
1.74
106984747--106984865
52
2.2
54
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7
145
31
11
0
55
1.42
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26
2.9
27
71
7
77
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12
0
51
1.40
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2.4
27
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29
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1
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1.56
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2.1
72
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0
266
28
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1.89
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0
4
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0
5
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6
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2.0
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1
186
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11
10
39
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2.1
15
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0
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318
23
29
18
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1.98
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144
1.9
144
83
4
353
24
28
18
28
1.98
107006497--107006773
48
5.8
48
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5
211
24
28
18
28
1.98
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2.2
23
92
0
82
26
20
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107010472--107010580
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5.1
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22
22
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18
2.1
19
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53
46
0
23
30
1.53
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22
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21
23
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3.1
19
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7
55
54
5
1
38
1.33
107018660--107018732
10
6.9
11
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10
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60
4
1
34
1.24
107018684--107018749
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2.0
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82
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1
4
31
1.25
107021819--107021876
25
2.3
25
84
0
71
18
22
22
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107021831--107021892
25
2.5
25
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5
81
19
24
20
35
1.96
107035226--107035382
39
4.0
39
93
0
251
29
20
26
23
1.99
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19.0
2
100
0
76
0
0
50
50
1.00
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4.4
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0
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42
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25
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1.64
107037424--107037535
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37
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0
197
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2.0
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23
27
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1.97
107050479--107050617
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2.9
47
87
4
190
22
21
21
34
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373