Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  347  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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196
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11.3
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
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Score
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22
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22
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1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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Entropy
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1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.90
115959836--115959873
3
12.7
3
100
0
76
34
0
0
65
0.93
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17
2.6
15
78
14
55
63
0
0
36
0.95
115960563--115960619
29
2.0
28
83
10
71
66
3
1
28
1.18
115960579--115960617
21
1.9
21
94
5
71
69
5
0
25
1.09
115977826--115977876
17
3.0
17
91
0
75
68
0
1
29
1.00
115993842--115993941
49
2.0
49
98
0
191
22
21
12
45
1.84
116001558--116002726
585
2.0
584
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0
2320
28
13
17
40
1.87
116003761--116003805
22
2.0
22
100
0
90
44
0
13
42
1.43
116003973--116004044
28
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44
0
4
51
1.20
116004206--116004240
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
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28
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27
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76
45
0
2
52
1.15
116004402--116004496
45
2.1
45
88
1
138
32
27
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34
1.79
116004477--116004528
16
3.2
16
94
0
86
34
36
0
28
1.58
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2.6
15
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10
5
0
84
0.77
116007868--116007906
14
2.7
14
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11
53
10
5
0
84
0.76
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18
2.1
18
100
0
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10
35
1.83
116024192--116024273
41
2.0
41
97
0
155
31
23
7
37
1.82
116027733--116027795
29
2.2
29
77
11
67
7
33
0
58
1.27
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177
4.6
176
78
9
757
31
18
24
26
1.97
116037980--116038008
9
3.2
9
100
0
58
44
0
0
55
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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41
1.9
42
87
7
119
21
32
25
21
1.98
116040359--116040402
6
7.3
6
94
0
79
50
13
15
20
1.78
116043572--116043627
28
2.0
28
82
6
69
23
5
0
71
1.06
116047819--116047859
6
6.5
6
83
10
55
14
0
4
80
0.87
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12
3.4
13
81
12
63
15
0
4
79
0.89
116047888--116047923
18
2.0
18
94
0
63
13
2
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38
1.59
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21
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12
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62
0
8
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32
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3
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53
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3
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23
1.33
116049800--116049873
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4.0
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67
66
4
6
22
1.33
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10.3
89
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12
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37
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15
28
1.91
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180
5.8
176
77
10
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37
18
15
28
1.91
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72
1.9
72
91
0
226
31
22
16
29
1.96
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177
3.9
160
72
16
428
37
18
15
28
1.91
116051724--116052558
342
2.4
338
81
9
880
37
18
15
28
1.91
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6.1
86
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11
475
38
18
15
28
1.90
116052033--116052558
177
3.0
175
80
7
559
38
18
15
28
1.91
116052464--116052495
15
2.1
15
94
0
55
56
9
9
25
1.61
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2.0
49
100
0
196
20
26
22
30
1.98
116064788--116064845
21
2.8
21
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12
66
62
0
8
29
1.25
116065573--116065627
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18.3
3
85
7
67
60
5
1
32
1.30
116065720--116065794
19
4.1
18
74
6
69
66
4
6
22
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116066372--116066412
13
3.2
13
83
16
59
19
2
0
78
0.87
116067028--116067066
7
5.4
7
93
6
69
12
0
43
43
1.42
116067538--116067611
25
2.9
25
82
8
69
54
0
1
44
1.08
116067569--116067601
14
2.3
15
94
5
59
60
0
0
39
0.97
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100
0
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0
0
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0.93
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18
100
0
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5
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1.50
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24
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4
4
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1.38
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18
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43
2.0
43
95
0
154
36
24
19
19
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          369   370   371   372   373