Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  148  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
49074922--49075175
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1.82
49083053--49083207
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1.9
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258
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21
8
41
1.82
49083186--49083369
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30
21
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39
1.83
49083047--49083223
81
2.2
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2
257
30
21
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39
1.83
49083186--49083462
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9
200
39
21
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1.84
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1.83
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0
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2.9
35
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19
42
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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1.92
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19
1.9
19
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2.0
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0
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0
0
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22
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2.0
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18
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2.1
41
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0
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24
29
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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43
16
16
22
1.88
49203038--49203090
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2.9
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43
16
16
22
1.88
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2.5
16
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0
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0
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5
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44
67
13
153
25
27
16
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
49237033--49237551
177
2.9
177
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27
26
16
28
1.97
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44
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263
25
22
26
25
2.00
49268404--49268448
22
2.0
22
100
0
90
22
17
8
51
1.73
49270053--49270114
26
2.4
26
80
0
79
27
22
27
22
1.99
49272345--49272373
11
2.6
11
100
0
58
44
13
0
41
1.44
49273562--49273639
38
2.1
38
97
0
147
35
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28
23
1.91
49275841--49275989
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3.2
45
77
12
133
29
18
29
22
1.97
49277043--49277084
22
2.0
22
90
4
68
16
40
21
21
1.91
49279924--49279973
26
2.0
26
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18
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20
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1.85
49280022--49280070
26
2.0
25
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64
10
24
26
38
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49283715--49283938
29
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28
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12
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21
1.92
49283767--49283841
27
2.6
28
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8
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12
25
25
1.90
49283708--49283926
114
1.9
114
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3
298
36
13
27
22
1.92
49314134--49314158
11
2.3
11
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0
50
44
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0
40
1.47
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15
4.0
15
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0
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49330895--49330963
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10
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1.63
49342488--49342526
20
2.0
20
89
0
60
35
10
2
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1.50
49345000--49345228
29
7.9
29
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160
21
27
14
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1.93
49345071--49345265
87
2.2
87
81
6
216
23
26
13
36
1.92
49345011--49345234
58
3.8
58
74
5
209
21
27
14
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
49345071--49345256
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3.2
57
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6
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22
27
13
36
1.92
49348977--49349026
25
2.0
26
92
4
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46
20
16
18
1.85
49351873--49351914
22
2.0
22
90
4
68
21
21
40
16
1.91
49352970--49353163
46
4.2
46
73
13
121
23
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18
28
1.98
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38
2.1
38
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0
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1.91
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37
2.8
37
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0
179
23
19
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25
1.98
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26
2.2
26
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15
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31
19
19
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1.96
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4
262
23
19
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26
1.98
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26
2.2
26
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3
64
37
22
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1.80
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4.2
27
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20
22
21
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1.96
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11.1
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2
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29
28
1.88
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143
3.3
143
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0
853
32
8
28
29
1.87
49392650--49392728
37
2.1
37
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4
115
26
18
29
25
1.98
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30
2.0
30
90
0
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36
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25
30
1.85
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2.5
15
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15
12
15
56
1.68
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40
5.6
40
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2
371
26
27
22
23
2.00
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18
2.4
19
81
11
56
47
13
15
22
1.81
49402192--49402445
27
9.4
27
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1
321
43
18
13
24
1.86
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3.2
39
80
10
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29
23
17
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1.97
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29
2.6
29
89
0
114
28
29
18
24
1.98
49413651--49413822
46
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46
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199
21
22
27
28
1.99
49413648--49413818
93
1.8
93
94
0
306
21
22
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
49417409--49417580
40
4.3
40
88
2
222
25
27
21
25
1.99
49417411--49417633
40
5.6
39
83
5
216
25
27
21
25
1.99
49417409--49417633
80
2.8
79
80
7
240
25
27
21
25
1.99
49417565--49417642
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
49425351--49425522
40
4.3
40
88
2
222
25
27
21
25
1.99
49425353--49425575
40
5.6
39
83
5
216
25
27
21
25
1.99
49425351--49425575
80
2.8
79
80
7
240
25
27
21
25
1.99
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24
1.99
49427742--49427829
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2.3
39
85
0
122
27
21
23
27
1.99
49432363--49432820
47
9.7
47
95
0
774
32
8
29
28
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373