Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  324  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108829741--108829862
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11
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1.97
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66
68
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208
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3
5
47
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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2.4
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59
32
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.08
109042599--109042765
41
4.1
41
87
6
207
35
22
22
19
1.96
109042621--109042765
41
3.5
41
93
0
236
33
22
22
21
1.97
109047752--109047803
19
2.7
20
82
8
63
59
7
0
32
1.26
109049040--109049150
42
2.6
41
87
4
141
21
13
31
33
1.92
109049520--109049571
24
2.2
24
86
6
70
34
3
7
53
1.48
109052639--109052678
11
3.6
11
82
0
53
20
10
10
60
1.57
109054130--109054161
7
4.6
7
92
0
55
40
3
12
43
1.58
109054586--109054661
41
1.9
40
84
7
102
50
3
1
44
1.29
109059742--109059771
5
6.0
5
100
0
60
40
0
0
60
0.97
109061012--109061066
27
2.0
28
89
10
87
54
0
7
38
1.28
109061013--109061068
25
2.1
27
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57
0
7
35
1.26
109061107--109061204
45
2.2
44
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10
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57
3
10
29
1.47
109061222--109061426
26
7.7
26
75
4
160
59
3
5
30
1.39
109065100--109065161
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28
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0
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30
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28
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0
97
32
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30
1.83
109075545--109075630
40
2.2
40
95
0
154
20
23
30
25
1.99
109075545--109075657
40
2.9
42
84
11
150
23
23
29
23
1.99
109080261--109080346
40
2.2
40
100
0
172
20
23
30
25
1.99
109080261--109080373
40
2.8
40
90
4
149
23
23
28
23
2.00
109082076--109082188
25
4.6
25
75
9
81
32
19
23
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109084587--109085080
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3.7
132
76
7
376
27
18
19
34
1.95
109084749--109085059
131
2.4
133
78
4
315
27
18
19
34
1.96
109095173--109095732
132
4.2
132
87
3
761
29
19
24
26
1.98
109095175--109095732
263
2.1
263
87
3
782
29
19
24
26
1.98
109098561--109099069
131
3.9
130
78
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434
26
20
19
32
1.97
109101995--109102112
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2.0
58
100
0
236
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1.70
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2.4
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3
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1
168
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23
1.94
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18
22
1.80
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2.2
45
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19
18
22
1.91
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2.0
53
100
0
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22
0
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1.54
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25
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0
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1.56
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0
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1.21
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0
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7
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42
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30
3.0
29
75
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79
27
29
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20
1.99
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2.2
19
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1.01
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2.1
30
100
0
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20
15
31
1.94
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31
2.0
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0
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26
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0
110
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7
27
1.80
109154596--109154620
6
4.2
6
100
0
50
16
0
16
68
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109162681--109162720
19
2.1
19
86
9
55
0
15
2
82
0.77
109166468--109166506
19
2.0
20
90
5
62
33
7
0
58
1.26
109170767--109170912
37
3.9
37
79
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28
13
41
16
1.85
109171178--109171523
165
2.1
163
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382
32
17
20
30
1.95
109172192--109172332
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0
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1.9
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19
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1.94
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18
1.9
19
88
5
56
38
13
13
33
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373