Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   

This is table  7  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2021688--2021728
20
2.0
20
100
0
82
56
14
4
24
1.58
2022539--2022580
21
2.1
21
86
8
61
66
0
0
33
0.92
2022549--2022588
21
1.9
21
85
10
55
62
0
5
32
1.17
2026568--2026617
19
2.5
20
83
3
57
30
0
6
64
1.18
2027697--2027725
5
5.8
5
100
0
58
20
0
0
79
0.74
2036503--2036560
30
1.9
30
96
0
107
58
8
1
31
1.38
2047554--2047626
32
2.5
28
82
10
83
39
4
2
53
1.34
2049926--2050010
31
2.7
31
76
7
84
41
9
5
43
1.61
2054687--2054761
28
2.7
28
83
6
82
33
0
1
65
1.01
2055345--2055388
23
1.9
23
86
9
63
61
4
0
34
1.16
2058690--2058714
13
1.9
13
100
0
50
0
0
12
88
0.53
2058893--2059030
40
3.5
39
78
11
131
40
21
18
19
1.91
2059070--2059265
41
4.8
41
92
0
311
19
20
26
32
1.97
2059835--2059866
15
2.1
15
94
0
55
25
0
34
40
1.56
2060584--2060651
21
3.2
21
75
10
66
23
0
39
36
1.55
2060732--2060829
50
2.0
49
91
2
160
21
2
33
42
1.64
2064399--2064455
27
2.2
26
81
9
62
28
7
0
64
1.19
2064703--2064845
43
3.4
42
86
6
198
28
18
30
21
1.97
2064903--2064946
22
2.0
22
95
0
79
43
27
20
9
1.82
2066977--2067069
18
5.2
18
90
0
141
27
24
17
30
1.97
2072589--2072636
23
2.1
23
100
0
96
4
8
18
68
1.31
2083150--2083184
18
1.9
18
88
0
52
5
14
17
62
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2088578--2088661
42
2.0
42
88
0
123
19
13
47
20
1.82
2095262--2095293
15
2.1
15
94
0
55
65
0
3
31
1.08
2095483--2095555
28
2.5
28
80
6
74
57
4
6
31
1.44
2095754--2095804
25
2.0
25
85
7
68
54
3
9
31
1.51
2098256--2098280
9
2.8
9
100
0
50
68
12
12
8
1.40
2110079--2110119
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
2112927--2113219
72
4.1
72
87
3
376
37
16
20
25
1.93
2122026--2122060
2
17.5
2
93
0
61
51
0
0
48
1.00
2131520--2131552
16
2.0
17
88
5
50
48
0
0
51
1.00
2134006--2134040
16
2.2
16
100
0
70
28
14
17
40
1.88
2134725--2134864
39
3.6
39
92
0
226
37
22
25
13
1.91
2144080--2144214
70
1.9
70
87
0
198
30
11
20
37
1.89
2145046--2145155
42
2.6
42
82
2
123
30
20
28
20
1.98
2149814--2150463
224
2.9
224
88
4
925
41
17
16
24
1.89
2155090--2155146
19
3.1
18
75
7
51
59
3
0
36
1.14
2170208--2170235
3
9.3
3
100
0
56
32
32
0
35
1.58
2172552--2172591
20
2.0
20
100
0
80
55
15
15
15
1.71
2174081--2174150
28
2.4
28
78
4
68
42
0
1
55
1.08
2174295--2174377
29
2.9
28
68
22
66
40
2
8
48
1.47
2177023--2177068
21
2.1
22
88
4
67
34
2
0
63
1.07
2177024--2177080
20
2.9
21
77
12
59
42
1
0
56
1.10
2178458--2178539
36
2.3
36
79
12
96
58
0
3
37
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2179302--2179333
9
3.4
10
87
12
50
65
9
0
25
1.22
2181359--2181393
18
1.9
18
88
0
52
57
0
5
37
1.23
2188211--2188248
19
2.1
19
85
14
53
68
2
0
28
1.03
2192786--2192867
40
2.0
40
97
0
155
54
10
8
25
1.63
2192856--2192900
16
2.7
17
82
3
56
48
6
8
35
1.61
2195520--2195560
21
2.0
21
85
0
55
24
4
7
63
1.40
2205751--2205806
24
2.5
22
80
11
67
60
5
7
26
1.44
2206809--2206833
7
3.6
7
100
0
50
0
0
12
88
0.53
2208127--2208160
14
2.4
14
90
0
50
67
2
11
17
1.34
2208339--2208627
54
5.4
54
95
2
505
40
18
13
28
1.88
2208339--2208627
106
2.7
108
93
3
505
40
18
13
28
1.88
2208574--2208869
86
3.4
84
80
11
325
35
19
17
28
1.94
2220437--2220492
24
2.5
22
80
11
67
60
5
7
26
1.44
2221888--2221921
15
2.3
15
94
0
59
26
8
50
14
1.72
2222861--2222902
21
2.0
21
90
0
66
64
2
0
33
1.07
2223115--2223178
33
1.9
34
87
9
96
57
10
10
20
1.62
2228034--2228088
28
2.0
28
96
0
101
20
27
20
32
1.97
2231184--2231231
18
2.6
17
75
12
51
27
0
6
66
1.15
2233203--2233229
14
1.9
14
100
0
54
14
3
0
81
0.82
2234152--2234193
20
2.0
21
90
4
68
35
2
2
59
1.23
2234152--2234252
25
4.1
24
77
16
84
34
4
4
55
1.43
2234182--2234246
27
2.3
28
82
12
80
35
6
6
52
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2234374--2234431
24
2.5
22
71
15
53
27
5
12
55
1.58
2236828--2236862
18
1.9
18
88
0
52
40
40
2
17
1.64
2237217--2237261
21
2.1
22
87
4
65
15
8
0
75
1.03
2237943--2237978
15
2.4
14
86
13
54
38
2
2
55
1.29
2238287--2238349
17
3.5
17
76
10
63
30
3
6
60
1.37
2238386--2238432
23
2.0
24
83
8
60
21
8
4
65
1.37
2238616--2238666
3
17.3
3
85
4
59
33
7
0
58
1.27
2238874--2238927
3
18.3
3
78
17
60
33
3
0
62
1.12
2241546--2241603
18
3.3
18
75
4
55
36
3
3
56
1.33
2242871--2243435
133
4.3
132
80
4
593
17
13
17
50
1.78
2248584--2248823
108
2.3
106
80
7
267
21
15
37
25
1.93
2248724--2248941
117
1.8
121
82
7
286
23
15
36
25
1.93
2249740--2249788
25
2.0
26
84
8
66
46
0
0
53
1.00
2253181--2253215
16
2.2
16
90
10
54
51
0
0
48
1.00
2253196--2253221
13
2.0
13
100
0
52
46
0
0
53
1.00
2253401--2253521
60
2.0
60
95
0
215
41
10
9
38
1.73
2263964--2263997
4
9.0
4
87
12
54
76
0
0
23
0.79
2264505--2264558
23
2.5
22
85
8
67
42
0
1
55
1.10
2264527--2264566
20
2.0
20
85
0
53
47
0
0
52
1.00
2273330--2273374
16
2.8
16
96
3
81
75
0
0
24
0.80
2273330--2273463
9
14.6
9
67
18
62
63
0
5
31
1.16
2275958--2275993
18
2.0
18
100
0
72
33
11
5
50
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2281168--2281229
16
3.8
15
83
12
70
64
1
1
32
1.13
2281164--2281224
24
2.5
24
81
7
70
65
1
1
31
1.12
2281164--2281229
8
8.0
8
78
10
62
65
1
1
31
1.11
2281364--2281579
25
9.0
25
70
18
104
56
3
6
33
1.41
2282107--2282234
30
4.4
30
89
5
199
19
4
49
26
1.68
2282126--2282234
57
1.9
57
94
0
191
21
4
49
24
1.68
2283002--2283045
13
3.3
13
84
6
61
63
6
13
15
1.49
2282982--2283045
14
4.5
14
79
11
67
62
4
12
20
1.47
2283028--2283277
75
3.3
73
82
8
270
36
19
18
26
1.95
2283068--2283271
77
2.7
75
84
5
268
35
19
17
27
1.94
2283215--2283325
54
2.1
54
91
0
177
41
15
12
30
1.84
2283332--2283580
76
3.3
75
82
4
279
35
19
18
26
1.95
2283063--2283738
309
2.2
309
96
0
1228
36
18
17
27
1.93
2283532--2283634
54
1.9
54
89
0
161
40
15
12
31
1.85
2283721--2283756
18
2.1
18
89
5
56
66
5
16
11
1.40
2283774--2284142
122
3.0
122
91
1
578
39
22
13
24
1.90
2284021--2284196
71
2.5
70
85
3
212
34
22
14
29
1.93
2292479--2292514
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
2294062--2294101
19
2.1
19
85
0
53
45
2
10
42
1.51
2294132--2294172
13
3.2
12
86
10
55
63
4
0
31
1.15
2294451--2294492
11
3.9
11
75
6
50
66
0
33
0
0.92
2294940--2295002
21
2.9
21
84
13
67
3
1
23
71
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2295816--2295861
19
2.4
19
85
7
58
58
6
2
32
1.36
2296371--2296398
13
2.2
13
100
0
56
14
0
14
71
1.15
2300475--2300526
19
2.7
20
84
6
70
26
38
1
32
1.68
2302650--2302679
10
3.1
10
95
4
53
6
10
0
83
0.81
2312894--2313296
72
5.6
72
89
5
563
31
20
17
30
1.96
2313253--2313350
51
1.9
50
89
6
153
39
18
12
29
1.87
2313190--2313430
129
1.9
123
86
10
344
36
19
15
28
1.92
2313303--2313485
79
2.5
76
79
16
224
34
22
16
26
1.95
2313450--2313551
52
1.9
53
90
9
165
39
14
15
30
1.88
2313382--2313617
121
1.9
122
91
5
390
35
20
16
27
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373