Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  292  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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19
122
31
20
27
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2
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24
89
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3.0
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230
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13
24
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99170654--99170807
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13
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1.94
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23
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38
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1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99227613--99227642
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13
35
10
1.78
99266242--99266417
71
2.5
69
85
1
217
28
14
23
33
1.94
99266435--99266776
72
4.5
75
86
5
449
32
15
20
32
1.93
99266421--99266771
149
2.3
147
84
7
427
31
14
19
33
1.93
99266435--99266776
78
4.5
76
86
5
451
32
15
20
32
1.93
99266999--99267244
88
2.8
87
85
4
298
28
17
19
34
1.94
99267166--99267733
73
7.6
73
86
7
649
31
17
19
31
1.95
99267166--99267733
147
3.8
147
83
7
658
31
17
19
31
1.95
99267175--99267733
306
1.9
294
86
5
787
31
17
19
31
1.95
99267391--99267683
159
1.9
159
90
1
473
29
17
21
31
1.96
99267307--99267874
232
2.4
232
84
6
729
28
18
20
32
1.96
99268021--99268188
89
1.9
90
85
3
232
29
18
19
32
1.95
99268869--99268931
22
2.9
22
92
0
108
26
50
9
12
1.71
99273135--99273160
4
6.5
4
100
0
52
76
23
0
0
0.78
99277748--99277804
28
2.0
28
96
0
105
42
17
12
28
1.85
99281840--99281903
31
2.0
34
84
9
89
51
4
3
40
1.38
99281840--99281909
32
2.2
30
82
10
77
51
4
2
41
1.36
99296032--99296102
35
2.0
35
94
0
124
36
19
11
32
1.87
99298216--99298329
59
1.9
59
90
0
183
52
7
4
35
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99298705--99298746
18
2.3
18
83
0
57
42
9
21
26
1.83
99299419--99299479
31
1.9
32
90
3
97
67
1
3
27
1.16
99300538--99300716
87
2.1
87
100
0
358
43
11
10
35
1.74
99303386--99303435
19
2.5
19
83
6
55
40
0
6
54
1.25
99313893--99313948
22
2.5
22
80
5
60
30
19
30
19
1.97
99313906--99313950
22
2.0
22
86
0
63
28
22
28
20
1.98
99321399--99321436
17
2.2
18
90
4
60
13
28
47
10
1.76
99342829--99342857
3
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3
100
0
58
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0
0
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2.0
27
100
0
110
21
23
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50
1.64
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2.2
44
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3
154
51
13
6
27
1.66
99355074--99355166
43
2.2
44
92
3
154
51
13
5
29
1.63
99359129--99359199
21
3.3
21
66
21
56
53
11
21
14
1.71
99359126--99359211
44
2.0
44
97
0
163
52
15
19
12
1.74
99363070--99363145
38
2.0
38
94
0
134
26
26
13
34
1.93
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114
2.0
114
92
1
376
28
26
11
33
1.91
99363298--99363348
22
2.3
22
96
0
93
47
0
5
47
1.26
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14
2.7
15
88
12
62
0
10
0
89
0.49
99368097--99368132
18
1.9
19
94
5
65
0
11
0
88
0.50
99368521--99368587
9
7.9
8
76
12
55
67
1
2
28
1.14
99368536--99368585
10
5.3
10
74
11
52
70
2
4
24
1.15
99368536--99368587
18
2.8
18
80
13
61
67
1
3
26
1.18
99368855--99368909
10
5.8
10
70
12
53
36
0
0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99369548--99369632
10
8.6
10
77
10
77
64
0
1
34
1.01
99369548--99369631
19
4.2
21
76
8
70
65
0
1
33
1.00
99369854--99369907
19
2.7
19
80
13
65
27
5
1
64
1.26
99369895--99369987
40
2.3
40
76
10
100
31
4
2
62
1.26
99369916--99369990
10
7.6
10
75
14
66
34
2
1
61
1.18
99369894--99369989
19
4.9
19
73
13
79
32
4
2
61
1.27
99381947--99381993
21
2.2
22
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11
53
38
21
2
38
1.65
99382210--99382261
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2.5
20
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13
11
1
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1.19
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3
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5
62
69
2
0
28
1.02
99387724--99387909
40
4.7
40
86
5
218
26
26
21
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373