Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  154  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51116759--51117289
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49
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20
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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29
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21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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34
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Indices
Period
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(0-2)
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148
27
27
20
24
1.99
51385492--51385677
80
2.3
80
83
9
229
27
27
20
23
1.99
51385494--51385677
40
4.6
40
83
7
205
27
27
21
23
1.99
51405390--51405609
45
5.0
45
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2
286
21
19
30
27
1.98
51407359--51407404
20
2.3
20
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32
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40
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0
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29
1.97
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44
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20
29
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1.99
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2.9
37
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0
189
25
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19
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47
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1.91
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23
26
24
25
2.00
51451967--51452056
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1.9
47
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0
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1.93
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0
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25
25
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27
1.99
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5.6
27
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27
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27
1.97
51455639--51455789
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1.9
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28
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1.97
51455638--51455815
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27
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10
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28
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1.96
51476370--51476405
16
2.2
17
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5
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55
5
5
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1.46
51476369--51476407
17
2.3
18
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13
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56
5
5
33
1.43
51476436--51476484
4
12.2
4
95
0
80
24
4
24
46
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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29
20
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1.99
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4.1
27
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23
17
1.93
51482732--51482842
54
2.1
53
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1
168
37
21
23
17
1.93
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4.3
50
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1.82
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2.1
16
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0
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1.98
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1.96
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1.9
174
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24
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1.95
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48
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19
26
26
1.99
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43
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21
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1.97
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2.3
21
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4
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1.62
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30
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1.98
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25
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14
1.80
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2.1
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1.16
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1
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1.30
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4.7
46
74
15
200
29
19
28
22
1.98
51541018--51541235
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2.3
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29
19
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1.98
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13
1.9
13
100
0
50
8
0
32
60
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
22
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0
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21
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3.4
27
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0
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1.99
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39
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0
180
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23
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1.97
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4.1
47
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0
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22
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1.94
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2.8
37
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0
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29
1.86
51591134--51591689
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5.8
92
93
2
756
33
8
28
29
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373