Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   

This is table  29  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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12
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1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8388528--8388609
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0
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25
13
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0
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95
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14
0
62
1.34
8392344--8392565
111
2.0
112
89
4
342
25
13
0
60
1.36
8392393--8392515
62
2.0
63
88
1
185
28
11
0
59
1.38
8392457--8392551
21
4.2
21
72
22
68
24
12
0
63
1.29
8392552--8392608
21
2.7
21
84
10
64
31
14
1
52
1.51
8394242--8394299
30
1.9
30
86
6
82
55
10
6
27
1.59
8394375--8394427
27
2.0
27
92
7
92
52
3
0
43
1.19
8394833--8394876
8
5.5
8
88
0
70
59
0
0
40
0.98
8399814--8399986
46
3.8
45
78
11
190
22
19
27
30
1.98
8399811--8399981
93
1.8
93
91
2
281
22
19
28
29
1.98
8400211--8400248
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
8402989--8403036
9
4.7
11
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17
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45
0
0
54
0.99
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20
2.5
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0
102
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0
0
54
0.99
8407198--8407261
24
2.7
24
97
0
119
17
29
15
37
1.91
8409503--8409557
17
3.2
17
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12
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21
0
1
76
0.88
8409503--8409551
5
9.0
5
82
12
53
18
0
2
79
0.83
8409503--8409551
22
2.2
22
80
16
57
18
0
2
79
0.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
39
97
0
155
41
6
13
39
1.69
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18
2.3
19
88
4
61
51
0
0
48
1.00
8421963--8422012
19
2.7
18
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3
64
52
0
0
48
1.00
8425788--8425878
45
2.0
45
89
0
137
40
8
15
35
1.78
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2.2
55
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5
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1.52
8431672--8431742
35
2.0
35
97
0
133
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5
2
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1.41
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2.0
31
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0
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0
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1.23
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21
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18
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1.97
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44
2.0
44
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0
149
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4
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32
1.30
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2.6
20
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1
20
1.07
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9
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10
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14
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63
1
4
30
1.26
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18
2.8
19
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3
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25
1.32
8444014--8444094
37
2.1
38
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119
62
2
6
28
1.32
8444013--8444095
38
2.2
40
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8
118
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2
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27
1.30
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1.9
58
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4
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0
0
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3
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223
2.0
223
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0
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18
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3.5
105
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33
14
18
33
1.91
8468798--8469191
196
2.0
196
96
0
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42
17
9
30
1.81
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13
9.6
13
75
20
115
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48
0
14
1.44
8476949--8477046
48
2.0
48
92
0
160
38
47
0
13
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8476949--8477061
35
3.2
35
81
5
131
37
48
0
14
1.44
8477475--8477559
23
3.6
23
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9
55
30
9
2
57
1.43
8483582--8483623
3
14.0
3
100
0
84
33
0
0
66
0.92
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105
2.6
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31
15
25
27
1.96
8489879--8489968
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2.5
37
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10
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56
1
2
40
1.19
8489929--8489970
22
1.9
22
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59
59
0
2
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1.10
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0
0
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17
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315
27
25
24
22
2.00
8547193--8547244
27
2.0
27
88
3
79
46
7
11
34
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373