Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  307  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
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1
44
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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19
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2.7
131
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0
401
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18
16
36
1.93
104021424--104021815
131
3.0
131
78
4
319
29
19
16
34
1.94
104022961--104022995
15
2.3
15
95
0
61
28
0
40
31
1.57
104025226--104025278
26
2.0
26
96
0
97
62
7
9
20
1.50
104027567--104027854
143
2.0
143
95
0
522
31
16
24
27
1.96
104028253--104028309
26
2.2
26
100
0
114
14
35
26
24
1.93
104030308--104030351
8
5.5
8
88
0
70
40
0
0
59
0.98
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7
179
23
15
26
35
1.94
104044144--104044198
25
2.2
25
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0
92
21
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1
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104048519--104048612
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31
24
18
25
1.97
104055540--104055594
19
2.8
19
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2
56
47
0
0
52
1.00
104073843--104073988
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2.0
72
87
4
193
26
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21
30
1.99
104078407--104078634
116
2.0
115
99
0
447
33
14
18
32
1.92
104082708--104082778
29
2.4
29
77
11
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30
7
21
40
1.79
104097325--104097374
22
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6
20
1.45
104098676--104098734
22
2.7
23
79
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47
0
1
50
1.11
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2.0
68
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3
232
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18
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1.82
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1.9
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5
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0
7
48
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6
5.7
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0
50
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18
10.4
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1
90
35
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14
38
1.82
104111093--104111316
47
4.8
48
83
9
209
23
19
27
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104111142--104111262
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2.6
47
100
0
242
23
19
28
28
1.99
104119005--104119180
46
3.8
46
78
10
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22
19
27
30
1.98
104119002--104119172
93
1.8
93
91
0
279
22
20
27
29
1.98
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15
2.1
15
100
0
64
25
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6
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33
3.4
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32
16
27
23
1.96
104126293--104126325
17
2.0
16
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5
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54
0
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1.41
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2.0
15
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0
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3
1.58
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2.0
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20
1.84
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4.8
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26
18
28
26
1.98
104144144--104144366
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2.4
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267
26
18
28
26
1.98
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25
2.0
25
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2
28
1.53
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2.0
37
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0
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21
1.94
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2.0
41
100
0
160
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1.66
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47
2.0
47
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0
112
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4
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104162750--104162836
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3.3
26
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10
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0
41
1.28
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2
15
0
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1.9
20
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2
15
0
82
0.79
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1.79
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2.0
16
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0
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1.90
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29
2.0
29
100
0
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13
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23
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23
100
0
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1.84
104187080--104187133
26
2.1
26
85
0
72
25
16
14
42
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104187439--104187482
23
1.9
23
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43
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15
34
1.74
104188518--104188574
27
2.1
27
100
0
114
42
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40
1.66
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11
3.1
11
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4
52
60
0
31
8
1.27
104199638--104199702
32
2.0
32
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0
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6
32
1.68
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2.5
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1
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0
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16
2.0
17
88
5
50
36
21
0
42
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          369   370   371   372   373