Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   

This is table  25  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
3
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0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
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Entropy
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2.0
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102
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22
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1.30
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0
40
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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70
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43
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7169876--7169991
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0
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0
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0
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11
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13
20
29
1.91
7174683--7174841
75
2.1
75
83
2
203
38
11
20
29
1.88
7174546--7174841
150
2.0
150
80
5
339
36
12
20
30
1.90
7179195--7179223
13
2.1
14
93
6
51
68
24
6
0
1.13
7179315--7179352
18
2.1
18
90
0
58
63
0
0
36
0.95
7187184--7187247
29
2.2
29
88
5
94
45
34
1
18
1.59
7187195--7187247
14
3.7
14
76
14
54
47
33
1
16
1.58
7187401--7187444
7
6.0
7
82
10
52
43
38
0
18
1.50
7187554--7188144
132
4.4
134
82
8
343
34
23
15
26
1.95
7187772--7188144
132
2.8
131
90
2
579
34
25
14
25
1.94
7188040--7188235
91
2.2
91
90
1
304
33
23
15
27
1.95
7188153--7188374
120
1.9
120
85
3
313
31
23
16
27
1.96
7190266--7190305
21
1.9
21
89
0
62
57
2
2
37
1.26
7195188--7195244
30
1.9
30
88
0
87
38
19
21
21
1.93
7195188--7195252
30
2.2
30
82
0
76
38
20
20
21
1.94
7200755--7200862
15
7.2
15
67
12
78
44
7
22
25
1.79
7200751--7200871
30
4.0
30
94
2
190
44
6
23
25
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7203754--7203850
3
32.3
3
77
8
90
29
7
2
60
1.35
7203986--7204054
34
2.0
34
85
5
93
36
5
1
56
1.32
7204151--7204185
13
2.6
13
90
4
52
17
2
0
80
0.84
7208140--7208247
15
7.2
15
69
12
87
43
7
23
25
1.79
7208133--7208247
30
3.8
30
97
0
203
44
6
23
25
1.78
7212286--7212358
29
2.5
29
81
0
74
58
5
5
30
1.43
7212486--7212553
27
2.5
27
76
4
75
25
29
32
13
1.93
7215171--7215221
24
2.1
25
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10
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23
1
3
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1.14
7217403--7217468
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3.2
21
77
12
75
28
3
4
63
1.29
7217388--7217491
3
34.3
3
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9
68
27
5
3
62
1.36
7217593--7217651
19
3.1
19
81
16
52
28
10
0
61
1.29
7217660--7217709
26
1.9
26
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0
73
32
10
0
58
1.31
7221401--7221535
56
2.5
54
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4
164
31
19
27
22
1.98
7221578--7221674
32
3.0
32
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3
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38
9
23
28
1.86
7227668--7227882
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56
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263
30
19
26
22
1.98
7227664--7227877
28
7.6
28
68
9
105
30
19
28
22
1.98
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32
2.3
32
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0
85
36
9
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27
1.87
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28
2.3
28
83
0
85
38
7
23
30
1.83
7230742--7231069
39
8.7
39
84
8
421
19
22
29
28
1.98
7230871--7230924
27
2.0
27
100
0
108
18
29
33
18
1.95
7230831--7230959
66
2.0
66
98
0
249
18
25
31
24
1.98
7230792--7231002
105
2.0
105
93
1
361
19
24
29
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7230753--7231027
144
1.9
145
93
0
471
19
23
29
27
1.98
7244013--7244331
134
2.4
133
81
6
344
31
21
22
23
1.98
7245039--7245082
18
2.5
17
85
7
52
43
2
0
54
1.12
7248239--7248339
24
4.4
24
70
19
81
30
2
3
62
1.28
7248531--7248652
50
2.4
48
75
18
115
32
11
2
53
1.50
7250058--7250188
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2.8
46
81
5
131
32
25
19
21
1.97
7261072--7261125
15
3.7
15
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11
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59
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2.0
30
93
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106
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11
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13
100
0
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0
0
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7272892--7272942
19
2.6
20
81
12
61
43
0
21
35
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373