Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  38  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10948769--10948851
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30
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2.1
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0
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1.9
33
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10
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1
1
38
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
16
24
1.80
11017683--11017853
58
2.9
58
75
6
175
47
11
16
24
1.80
11017954--11017999
24
1.9
24
82
8
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18
26
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10
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22
29
18
28
1.98
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256
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28
19
29
1.98
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140
1.9
140
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356
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29
18
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1.98
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1.99
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1.99
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2.0
21
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2.0
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10
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1.9
18
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2.0
22
100
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22
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2.1
85
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0
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30
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3.5
17
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13
50
48
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1
10
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11075173--11075280
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2.1
52
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0
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32
1.78
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0
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11076318--11076371
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2.3
23
90
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83
24
0
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74
0.92
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22
0
2
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2.0
201
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2.4
884
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2791
26
24
15
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
49
1.62
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18
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24
18
12
45
1.84
11159738--11159791
23
2.5
23
82
8
60
61
7
0
31
1.24
11160000--11160045
15
2.9
15
87
6
56
67
2
6
23
1.25
11159994--11160083
44
2.0
44
81
12
105
65
1
7
25
1.26
11160038--11160082
15
2.9
15
87
9
56
64
0
6
28
1.19
11160652--11160678
5
5.4
5
100
0
54
81
0
0
18
0.69
11161349--11161420
31
2.3
31
87
0
99
48
12
11
27
1.75
11162991--11163031
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
11163557--11163628
24
2.9
26
77
10
78
48
13
0
37
1.43
11164321--11164381
26
2.3
26
100
0
122
3
18
4
73
1.14
11164491--11164524
12
2.8
12
83
16
52
52
5
0
41
1.25
11165124--11165161
15
2.5
15
83
8
51
44
2
2
50
1.30
11166724--11166993
43
6.3
43
76
2
213
31
25
15
27
1.95
11166744--11166994
85
3.0
86
78
1
274
31
26
14
27
1.95
11167190--11167248
12
4.8
12
75
4
55
67
3
1
27
1.16
11167234--11167263
15
1.9
16
93
6
53
63
0
3
33
1.11
11174335--11174407
26
2.8
26
87
0
92
30
17
10
41
1.84
11174779--11174846
30
2.3
30
82
5
75
47
4
19
29
1.69
11177220--11177630
46
9.0
46
88
1
520
41
14
22
21
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11178970--11179016
23
2.0
23
100
0
94
38
21
12
27
1.90
11179709--11179745
19
1.9
19
100
0
74
32
32
8
27
1.86
11197503--11197549
23
2.0
23
91
0
76
40
8
17
34
1.79
11197557--11197608
26
2.0
26
100
0
104
34
7
3
53
1.48
11197560--11197615
26
2.2
26
93
0
94
37
7
5
50
1.53
11198952--11198999
23
2.1
23
100
0
96
47
8
8
35
1.64
11203205--11203265
18
3.6
18
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17
58
44
14
6
34
1.72
11203210--11203286
32
2.4
32
95
0
136
49
18
3
28
1.65
11203470--11203570
44
2.3
44
80
10
109
36
22
18
21
1.95
11206025--11206052
5
5.6
5
100
0
56
60
0
0
39
0.97
11208803--11209089
40
7.2
40
89
2
373
25
28
24
22
1.99
11216097--11216159
20
3.0
20
80
13
65
55
1
3
39
1.25
11220740--11220814
25
3.0
24
69
11
60
20
8
41
30
1.81
11222161--11222249
36
2.5
36
77
0
106
43
4
21
30
1.72
11223271--11223501
80
2.9
78
83
7
268
33
24
14
27
1.94
11225610--11225641
16
2.0
16
100
0
64
25
0
6
68
1.12
11226617--11226648
2
16.0
2
100
0
64
0
50
0
50
1.00
11229406--11229440
17
2.1
17
94
0
61
40
2
5
51
1.40
11231151--11231182
16
2.0
16
100
0
64
37
25
6
31
1.81
11232572--11232604
2
16.5
2
100
0
66
51
0
48
0
1.00
11232602--11232641
3
13.3
3
100
0
80
67
0
32
0
0.91
11243377--11243438
29
2.2
28
82
8
72
37
8
14
40
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11245250--11245291
18
2.3
18
87
0
57
42
16
2
38
1.61
11246857--11246926
29
2.3
30
83
9
81
35
8
14
41
1.76
11247070--11247163
31
3.1
30
74
6
91
44
13
8
32
1.74
11251719--11251802
42
2.0
43
84
11
111
28
19
22
29
1.98
11255152--11255189
18
2.1
18
90
5
58
39
13
15
31
1.86
11266389--11266418
6
5.0
6
95
0
51
0
16
63
20
1.31
11275885--11275911
8
3.4
8
100
0
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0
0
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0.50
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2.0
33
96
0
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22
22
1.91
11288641--11288763
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2.4
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90
5
196
35
15
22
26
1.94
11288745--11288924
31
5.8
31
90
2
254
28
19
26
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373