Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  227  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
29
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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22
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33
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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21
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3.9
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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12
1.61
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1.61
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1.00
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2.1
32
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32
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21
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1.84
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1.18
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1
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1.07
77328947--77329043
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1.18
77330427--77330465
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20
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1
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13
3.4
13
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9
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22
11
18
47
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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39
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13
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1.92
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93
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1.97
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20
1.97
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2.8
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0
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48
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28
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1.83
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28
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2.4
13
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0
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25
21
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1.99
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40
4.7
39
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5
187
24
20
27
26
1.99
77448724--77448907
80
2.3
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212
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21
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1.99
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2.1
17
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52
14
0
32
52
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77452267--77452323
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2.5
23
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0
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17
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54
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0
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19
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77454405--77454531
48
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146
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18
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77475064--77475268
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4.8
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1
4
52
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373