Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  272  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
20
27
28
1.99
92475997--92476121
45
2.7
45
81
11
139
23
31
17
28
1.97
92487163--92487189
13
2.1
13
100
0
54
33
29
22
14
1.94
92494543--92494764
46
4.8
44
77
14
200
22
29
20
27
1.99
92494590--92494760
94
1.8
92
86
7
247
22
28
21
28
1.99
92500608--92500788
89
2.0
89
94
0
317
28
23
12
35
1.92
92505020--92505060
20
2.0
20
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9
57
34
17
2
46
1.61
92507593--92507675
25
3.3
25
76
3
78
39
30
9
20
1.84
92507644--92507694
25
2.0
25
85
7
68
37
25
15
21
1.93
92514992--92515032
18
2.4
18
88
8
59
46
21
4
26
1.72
92516916--92516945
8
3.9
8
91
8
53
53
10
0
36
1.35
92549457--92549481
13
1.9
13
100
0
50
56
12
16
16
1.68
92549946--92549972
6
4.5
6
100
0
54
18
0
0
81
0.69
92550470--92550536
24
2.8
24
75
16
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31
0
1
67
1.00
92550611--92550851
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2.0
121
100
0
482
19
38
24
17
1.93
92550958--92551021
24
2.7
23
77
13
67
75
0
23
1
0.90
92551171--92551304
60
2.2
61
86
4
191
32
0
11
55
1.36
92554508--92554602
33
2.9
33
80
3
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14
49
11
24
1.76
92559827--92559873
22
2.2
21
82
14
53
53
4
8
34
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92559848--92559900
27
2.0
26
81
3
61
60
3
7
28
1.41
92559809--92559951
47
3.0
49
76
16
131
54
4
6
33
1.49
92559827--92560296
23
19.7
23
69
20
154
55
4
5
33
1.45
92559827--92559962
25
5.7
23
67
20
59
54
5
6
33
1.49
92560092--92560278
24
7.7
23
75
17
112
56
5
4
33
1.43
92560457--92560514
26
2.2
26
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11
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62
5
3
29
1.33
92560458--92560521
15
4.5
15
69
25
50
60
6
3
29
1.36
92562164--92562273
44
2.5
46
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4
136
26
25
18
30
1.98
92562261--92562349
44
2.0
45
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2
135
28
25
20
25
1.99
92562545--92562600
29
1.9
29
85
7
78
25
33
21
19
1.97
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1.8
89
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0
200
35
19
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26
1.94
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2.2
75
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1
228
34
19
19
26
1.96
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1.8
89
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4
220
34
20
17
26
1.95
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2.2
76
84
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1.92
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4.2
76
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2
476
35
21
16
26
1.95
92562968--92563290
152
2.1
150
88
3
486
35
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16
26
1.94
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22
2.2
21
82
14
53
53
6
6
34
1.52
92575455--92575507
27
2.0
26
81
3
61
60
3
7
28
1.41
92575493--92575560
25
2.8
24
80
6
82
54
5
7
32
1.52
92575648--92575677
14
2.1
14
100
0
60
53
13
6
26
1.64
92575698--92575907
23
8.6
25
76
13
174
56
5
5
32
1.44
92575755--92575888
24
5.3
28
72
23
84
60
5
2
30
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92575753--92575888
48
2.7
47
83
14
159
59
5
2
31
1.36
92576008--92576037
15
2.0
15
93
0
51
63
0
3
33
1.11
92579364--92579420
10
5.5
10
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35
5
1
57
1.31
92584819--92584946
25
5.1
25
77
11
111
21
29
18
30
1.97
92584840--92584946
50
2.1
50
84
6
137
20
28
20
29
1.98
92584876--92584964
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10
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21
25
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1.99
92584852--92584958
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2.1
50
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128
20
28
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1.99
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229
29
17
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25
1.98
92587465--92587649
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2.0
93
87
6
266
29
17
27
25
1.98
92587471--92587674
94
2.2
94
84
5
252
29
17
26
25
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373