Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  194  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65235018--65235096
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37
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201
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2.7
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2.1
37
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4
106
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1.98
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2.00
65249028--65249250
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26
2.00
65257001--65257261
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80
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90
0
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25
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23
1.99
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2.2
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273
26
21
28
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1.99
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2.6
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223
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22
28
22
1.99
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39
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0
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19
22
30
1.98
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1.98
65287710--65287982
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28
19
26
25
1.99
65295424--65295561
48
2.8
48
83
4
170
26
21
27
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65299798--65300225
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50
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20
27
1.99
65299896--65300227
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47
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214
23
28
21
27
1.99
65299798--65300225
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4.4
96
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392
24
28
20
27
1.99
65301528--65301730
53
3.8
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187
20
23
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14
2.1
15
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3
0
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1.06
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25
0
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50
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10
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1.99
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3.9
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1
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26
27
19
26
1.99
65309130--65309502
192
1.9
192
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498
26
27
19
26
1.99
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20
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0
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2.0
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1.93
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1.98
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273
26
19
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1.97
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1.99
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4.8
48
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238
26
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1.97
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2.4
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249
26
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2.0
47
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2
174
21
18
17
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1.90
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5.2
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174
24
26
17
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1.97
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3.3
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306
24
27
17
29
1.98
65361341--65361551
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4.5
43
75
14
120
24
17
30
27
1.97
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50
6.6
50
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179
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25
1.98
65389300--65389409
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2.0
55
89
3
168
31
19
18
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
26
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2.1
31
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19
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1.75
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13
2.1
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51
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0
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19
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2
14
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1.57
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25.2
106
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1.47
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2
6
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1.35
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2.0
21
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19
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0
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19
1.69
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1.94
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241
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1.94
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16
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20
65
35
3
21
39
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65483626--65483683
28
2.1
28
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0
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36
3
20
39
1.70
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22
2.1
20
83
8
52
36
4
25
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1.76
65491747--65491901
39
4.0
39
94
0
256
21
29
23
24
1.99
65495091--65495152
27
2.3
27
88
0
88
45
17
12
24
1.84
65495091--65495159
27
2.6
27
85
0
75
44
18
14
21
1.85
65496423--65496591
46
3.7
46
75
13
175
28
27
21
22
1.99
65496428--65496598
93
1.8
93
89
0
270
27
28
22
22
1.99
65497023--65497082
30
2.0
30
86
0
84
30
23
8
38
1.84
65497850--65497999
54
2.8
54
79
7
187
32
4
18
44
1.71
65497850--65498002
27
5.7
26
82
7
155
32
5
18
43
1.73
65500993--65501237
40
6.2
40
91
2
327
26
28
21
24
1.99
65503186--65503244
27
2.2
26
84
3
73
25
23
15
35
1.94
65510737--65511592
47
18.2
47
92
0
1381
27
29
8
33
1.87
65515381--65515444
33
2.0
32
84
3
83
20
23
20
35
1.96
65515406--65515465
27
2.3
26
85
2
75
21
23
20
35
1.96
65517284--65517321
15
2.5
15
100
0
76
28
34
15
21
1.94
65535490--65535549
31
1.9
31
96
0
111
21
36
25
16
1.94
65537524--65538029
48
10.9
48
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10
214
28
17
24
29
1.97
65537580--65537991
90
4.5
90
75
10
350
28
16
24
29
1.97
65537532--65538039
138
3.7
138
92
2
770
28
17
24
29
1.97
65539029--65539201
83
2.1
83
98
0
337
27
27
23
21
1.99
65545887--65545944
30
1.9
30
100
0
116
37
6
24
31
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65548453--65548632
55
3.3
55
74
2
150
18
23
18
38
1.93
65554403--65554442
21
1.9
21
94
0
71
35
17
17
30
1.93
65555865--65556232
48
7.9
48
74
8
321
28
19
24
27
1.98
65555873--65556233
138
2.6
138
88
0
551
28
18
24
27
1.98
65559304--65559386
43
1.9
43
87
0
121
30
15
22
31
1.95
65561259--65561699
220
2.0
220
99
0
873
26
17
25
30
1.97
65563430--65563504
31
2.4
31
93
0
123
28
29
17
25
1.97
65563528--65563619
42
2.2
42
96
0
166
39
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11
27
1.89
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2.4
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10
86
28
21
20
30
1.98
65563767--65563862
26
3.8
26
86
5
126
28
21
25
25
1.99
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27
2.9
26
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14
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19
20
23
37
1.95
65564790--65564875
27
3.1
27
80
11
102
37
9
15
38
1.79
65564873--65564975
27
3.8
26
77
8
109
30
8
20
40
1.82
65565009--65565098
27
3.3
26
81
3
99
42
10
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26
1.84
65566562--65566632
23
3.1
22
84
8
90
21
22
18
38
1.94
65578441--65578491
22
2.5
20
83
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57
58
11
0
29
1.33
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14
2.5
13
90
9
50
39
0
27
33
1.57
65585772--65585924
42
3.6
42
80
2
164
30
16
22
30
1.96
65591080--65591130
26
2.0
26
84
0
66
21
19
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43
1.88
65596543--65596654
50
2.3
47
83
6
136
28
20
15
35
1.93
65600870--65600983
48
2.4
47
85
2
149
28
21
14
35
1.92
65600870--65600990
46
2.6
47
84
2
136
27
21
14
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65605134--65605247
48
2.4
48
83
2
142
29
21
14
34
1.93
65609431--65609549
45
2.6
47
84
6
145
26
22
14
36
1.93
65613957--65614162
40
5.2
40
92
1
335
28
26
21
23
1.99
65615580--65615607
13
2.2
13
100
0
56
57
14
0
28
1.38
65617515--65617577
27
2.3
27
86
0
81
38
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17
25
1.93
65617712--65617762
27
1.9
26
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4
66
21
23
21
33
1.97
65617712--65617768
27
2.2
26
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3
60
24
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2.00
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2.5
12
94
0
51
16
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50
1.70
65628938--65629029
21
4.3
21
78
9
89
14
22
18
44
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373