Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  75  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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19
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20
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21
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80
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20
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55
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2.2
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2.7
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5
62
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.24
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2
35
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23270127--23270218
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20
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15
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22
1.95
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17
4
1
76
1.01
23293454--23293531
6
12.8
6
72
12
61
17
3
1
76
1.00
23293459--23293531
5
13.6
5
77
20
60
17
4
1
76
1.01
23298411--23298696
144
2.0
143
86
3
405
46
11
9
32
1.72
23299116--23299156
19
2.2
19
91
8
66
65
0
0
34
0.93
23299282--23299335
20
2.7
21
85
5
67
61
7
0
31
1.24
23299300--23299346
20
2.2
20
85
7
58
63
8
0
27
1.23
23299459--23299530
29
2.5
28
82
8
83
55
4
1
38
1.28
23299408--23299603
9
21.0
9
69
23
113
62
2
1
34
1.16
23300021--23300053
15
2.2
15
94
0
57
87
0
3
9
0.63
23300019--23300053
7
4.9
7
86
6
52
85
0
2
11
0.69
23300180--23300282
51
2.1
48
83
5
125
28
0
4
66
1.19
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18
3.3
18
78
17
54
31
0
4
63
1.15
23300240--23300466
9
24.8
9
69
21
118
34
0
3
61
1.18
23300366--23300455
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42
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34
0
2
63
1.07
23300370--23300461
35
2.6
35
83
15
109
35
0
2
61
1.08
23300763--23300806
20
2.2
20
91
0
70
65
6
2
25
1.28
23301013--23301061
21
2.4
21
82
3
64
16
0
10
73
1.09
23301021--23301067
21
2.2
21
88
0
67
19
0
8
72
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23301525--23301550
5
5.2
5
100
0
52
38
23
19
19
1.93
23316138--23316178
21
2.0
21
85
0
55
26
7
39
26
1.82
23319121--23319158
13
2.9
13
85
14
60
39
23
5
31
1.77
23334536--23334840
80
3.8
79
86
3
339
26
21
26
25
1.99
23334536--23334838
40
7.6
39
79
10
265
26
21
26
25
1.99
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3.2
80
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26
22
27
24
1.99
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80
3.8
80
86
3
352
26
21
27
25
1.99
23341965--23342267
40
7.6
39
79
10
274
26
21
27
25
1.99
23342048--23342302
80
3.2
80
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5
234
26
21
27
23
1.99
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2.1
32
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125
40
25
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6
24.3
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16
18
1.82
23352161--23352300
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4.5
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2
176
48
15
17
18
1.81
23352422--23352505
27
3.2
26
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5
114
38
20
22
19
1.94
23352541--23352610
32
2.2
31
80
7
77
35
22
18
22
1.95
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22
2.6
22
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0
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36
22
20
20
1.95
23353091--23353277
27
7.0
27
85
2
234
25
19
19
35
1.95
23353120--23353277
53
2.9
54
91
1
246
25
19
17
36
1.94
23353109--23353277
80
2.1
81
88
1
250
24
19
19
36
1.95
23353268--23353394
27
4.7
28
81
6
136
27
7
23
40
1.82
23353109--23353312
54
3.8
52
84
7
214
25
17
20
36
1.94
23353120--23353331
107
2.0
108
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10
238
26
17
18
36
1.93
23356083--23356125
18
2.4
18
84
7
52
32
16
32
18
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23385259--23385298
6
6.7
6
94
0
71
55
0
27
17
1.43
23387134--23387302
71
2.4
71
80
4
180
27
15
20
36
1.93
23388859--23388981
52
2.4
52
90
2
185
36
16
22
24
1.94
23388859--23388981
24
4.7
27
78
15
141
36
16
22
24
1.94
23389005--23389203
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3.9
51
87
0
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32
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1.95
23411015--23411075
30
2.0
30
83
0
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31
22
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1.84
23413762--23414010
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5.0
50
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29
25
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0
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1.92
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2.2
141
81
0
371
27
28
11
32
1.92
23422280--23422649
42
8.8
42
86
1
472
24
19
24
32
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373