Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  296  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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20
21
1.98
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Period
Size
Copy
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Percent
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Score
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Period
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1.81
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Period
Size
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Number
Consensus
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A
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(0-2)
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10
5
45
1.60
100611457--100611554
39
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37
77
4
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31
4
6
58
1.42
100611540--100611587
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9
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27
2
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70
0.98
100611550--100611602
18
2.6
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88
11
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20
0
3
75
0.96
100611550--100611610
10
6.3
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78
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52
21
1
3
73
1.06
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33
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0
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0
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238
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0
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0
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16
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21
3.3
21
75
0
66
14
24
20
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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22
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0
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28
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4.0
42
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13
160
31
26
13
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100754335--100754440
49
2.2
48
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29
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4.8
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0
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26
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82
15
61
42
12
24
22
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373