Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  35  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10101049--10101220
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27
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2
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1.12
10103887--10103925
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58
2
0
38
1.12
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10
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0
0
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0
0
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0
0
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10107268--10107408
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23
18
1.95
10114224--10114381
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54
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17
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110
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2.5
26
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0
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36
24
6
33
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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2.0
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23
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20
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30
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53
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2.1
21
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10195860--10195994
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4.5
30
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1
175
26
48
3
21
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10195877--10195929
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18
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5.5
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4
3
57
1.34
10196548--10196698
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5.6
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12
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7
4
53
1.51
10196497--10196618
25
5.0
25
70
10
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4
3
56
1.35
10196640--10196698
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2.5
24
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1.59
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2
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19
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1.94
10214165--10214860
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2.6
268
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17
19
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2.0
25
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1.57
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1.16
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2.1
17
89
5
54
47
2
5
44
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10220671--10220827
79
1.9
82
82
10
198
34
23
7
35
1.82
10220677--10220844
79
2.1
81
79
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184
36
22
7
33
1.82
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80
81
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197
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11
8
36
1.71
10220988--10221050
33
1.9
33
93
0
108
44
9
11
34
1.73
10221175--10221252
20
3.9
19
79
14
77
44
10
8
35
1.70
10221459--10221586
20
6.5
20
69
13
95
42
11
10
35
1.77
10221491--10221599
40
2.7
39
78
10
105
44
11
9
35
1.72
10221755--10221858
20
5.2
20
74
12
97
32
13
12
41
1.82
10221755--10221848
41
2.3
42
83
5
113
32
12
11
42
1.79
10223501--10223534
12
2.8
12
90
4
50
41
0
44
14
1.45
10224910--10225082
93
1.9
93
93
2
303
27
30
21
21
1.98
10224903--10225078
46
3.8
46
77
12
198
28
29
21
21
1.98
10224911--10225097
46
4.0
44
68
21
114
28
28
20
21
1.98
10229257--10229338
42
2.0
42
100
0
164
29
15
25
29
1.96
10229820--10229857
3
12.7
3
100
0
76
68
0
0
31
0.90
10230902--10230936
2
18.0
2
88
5
54
51
2
45
0
1.16
10233467--10233542
11
7.3
10
72
21
50
55
0
6
38
1.26
10234153--10234206
22
2.3
24
81
9
67
35
1
7
55
1.39
10239053--10239319
48
5.6
48
76
5
209
26
17
29
26
1.98
10239036--10239319
96
3.0
96
86
1
363
26
16
29
27
1.97
10243984--10244030
20
2.3
21
82
17
64
59
2
4
34
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10245326--10245357
13
2.5
13
94
0
55
40
6
18
34
1.76
10246480--10246520
21
1.9
22
85
14
59
26
7
7
58
1.51
10246805--10246870
35
2.0
34
85
8
91
39
4
7
48
1.52
10247278--10247344
34
1.9
35
87
3
100
32
7
11
47
1.68
10247424--10247473
18
2.8
18
90
0
73
44
2
0
54
1.11
10258384--10258470
30
2.9
29
75
8
93
22
2
13
60
1.44
10258793--10258832
21
2.0
20
85
5
53
52
12
5
30
1.60
10262810--10262938
35
3.7
34
78
6
116
38
25
13
22
1.90
10265112--10265418
46
6.4
45
87
8
312
35
14
22
28
1.93
10265053--10265418
52
7.6
49
85
10
431
34
13
22
29
1.93
10265053--10265418
98
3.7
97
84
9
501
34
13
22
29
1.93
10265315--10265492
37
4.3
44
86
9
181
37
14
21
26
1.92
10265382--10265490
37
3.0
37
93
2
186
36
16
22
24
1.94
10266742--10266932
49
3.9
49
93
3
305
24
14
30
30
1.95
10266742--10266932
96
2.0
99
90
3
307
24
14
30
30
1.95
10270049--10270318
52
5.3
52
87
6
383
35
13
22
27
1.92
10270043--10270318
98
2.8
98
90
5
403
35
13
22
28
1.93
10270279--10270426
37
4.0
37
87
9
214
37
14
22
25
1.93
10271677--10271866
49
3.9
49
93
4
305
24
14
30
30
1.95
10271677--10271866
95
2.0
99
90
4
307
24
14
30
30
1.95
10275034--10275326
89
3.1
89
82
12
365
35
14
20
29
1.92
10274968--10275310
141
2.4
143
91
4
550
34
14
20
30
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10275034--10275326
51
6.3
46
88
7
355
35
14
20
29
1.92
10274968--10275310
95
3.6
96
81
11
441
34
14
20
30
1.93
10275291--10275398
36
3.0
36
90
8
175
37
16
21
25
1.94
10276650--10276842
49
3.9
49
94
0
323
23
16
30
30
1.96
10279962--10280327
46
7.6
49
85
10
438
34
13
22
29
1.93
10279962--10280327
98
3.7
97
85
8
508
34
13
22
29
1.93
10280291--10280400
37
3.0
37
94
1
195
37
16
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1.93
10279962--10280316
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2.4
147
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2
459
34
14
21
29
1.93
10287986--10288149
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4.7
35
81
4
172
39
29
12
18
1.87
10289825--10289858
9
3.4
10
88
12
52
79
0
17
2
0.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373