Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  295  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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Period
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Copy
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Consensus
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indices
Period
Size
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Number
Consensus
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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36
1.24
100172227--100172257
16
2.0
15
93
6
53
64
0
0
35
0.94
100172554--100172651
18
5.5
18
86
4
137
36
12
11
39
1.78
100172554--100172660
35
3.0
35
93
4
169
37
13
10
39
1.78
100173035--100173384
165
2.1
165
93
2
596
27
20
20
31
1.98
100173035--100173384
83
4.2
83
93
2
598
27
20
20
31
1.98
100173308--100173879
119
4.8
119
93
2
917
30
19
17
32
1.95
100173888--100174067
44
4.1
44
76
8
195
27
25
16
31
1.96
100174932--100174974
20
2.1
21
86
4
61
4
23
0
72
1.04
100174938--100174991
20
2.7
20
88
8
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3
12
0
83
0.78
100174939--100174994
13
4.2
13
73
13
60
1
12
0
85
0.67
100180853--100180917
21
3.1
21
78
8
62
61
0
4
33
1.16
100180861--100180977
21
5.2
21
72
19
71
60
0
2
35
1.16
100181273--100181344
19
3.9
18
87
10
103
36
13
11
38
1.81
100181266--100181344
35
2.2
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35
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100181287--100181342
17
3.5
15
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9
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35
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10
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1.83
100181276--100181357
35
2.3
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1.80
100195404--100195698
78
3.8
78
90
1
466
31
20
23
24
1.98
100195638--100195867
45
5.1
45
76
7
214
31
16
26
25
1.97
100196226--100196289
17
3.6
17
87
8
92
37
12
14
35
1.83
100196226--100196289
18
3.6
18
93
4
103
37
12
14
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100196218--100196289
19
3.9
19
89
10
114
37
12
13
36
1.83
100196250--100196312
23
3.0
22
84
11
71
36
7
17
38
1.79
100196579--100196614
18
2.0
18
89
10
56
30
0
0
69
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26
2.0
27
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7
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15
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26
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0
150
36
25
4
33
1.77
100201190--100201240
24
2.1
24
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0
75
37
1
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1.29
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2.0
16
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0
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0
6
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1.45
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0
28
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2.0
21
100
0
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0
25
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2.1
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51
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0
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1.18
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2.4
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10
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6
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1.45
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1.9
23
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4
70
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1.43
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2.1
54
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0
215
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1.9
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2.0
74
100
0
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20
32
1.91
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2.3
19
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36
4
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51
1.51
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2.0
286
95
0
1031
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1.90
100258667--100258710
20
2.2
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2
1.61
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2.1
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0
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0
16
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32
2.0
32
93
0
108
38
15
19
26
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100284935--100284978
16
2.6
17
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52
0
0
47
1.00
100288384--100288448
31
2.0
31
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11
85
70
4
1
23
1.14
100322615--100322699
42
2.0
42
86
8
120
28
14
28
29
1.95
100328756--100328813
28
2.1
27
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0
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2.0
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13
2.2
14
94
5
53
26
33
30
10
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373