Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  365  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120783102--120783148
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0
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27
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2.5
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4
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8
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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2.0
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42
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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2.0
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61
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120876789--120876832
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201
20
19
29
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120915280--120915450
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21
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21
2.2
21
92
0
76
29
4
25
40
1.75
120917956--120917985
3
9.7
3
92
7
51
36
0
0
63
0.95
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125
2.0
124
98
0
480
28
4
7
59
1.43
120918331--120918362
16
2.0
16
93
0
55
21
21
6
50
1.71
120918451--120918487
3
12.3
3
100
0
74
35
0
0
64
0.94
120918579--120918667
22
4.1
22
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11
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22
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4
67
1.30
120924433--120924483
10
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15
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35
1
21
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120927981--120928020
21
1.9
21
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0
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45
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120928374--120928481
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120931141--120931247
23
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23
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20
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120931241--120931297
29
1.9
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1.61
120931547--120931631
27
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26
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5
7
54
1.52
120931572--120931631
26
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26
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8
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1.48
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10
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0
10
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120931912--120932005
25
3.8
25
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4
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120931931--120932015
25
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4
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120931970--120932015
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1.9
23
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2
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1.28
120932049--120932090
21
2.0
22
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0
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15
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0
50
35
0
0
64
0.94
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18
2.0
18
94
0
63
36
16
2
44
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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8
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6
26
17
50
1.70
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20
2.1
22
87
8
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45
0
4
50
1.22
120945013--120945050
20
1.9
19
94
5
67
50
15
2
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1.58
120945034--120945071
14
2.7
15
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0
2
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2.1
25
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0
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26
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0
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2.0
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1.20
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0
0
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27
1.83
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2.4
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13
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0
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2.0
90
100
0
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16
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0
4
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3.8
16
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10
56
68
1
0
29
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120999461--120999781
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5.7
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10
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22
57
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120999476--120999763
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2.5
112
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296
11
9
21
56
1.63
120999589--120999683
29
3.1
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22
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11
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120999419--120999798
55
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24
2.0
24
83
4
60
37
20
22
18
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373