Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  64  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19304296--19304362
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19334596--19334798
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3.8
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248
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24
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1.95
19341279--19341445
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0.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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1
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14
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2
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1.16
19375917--19375983
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1.25
19375910--19375955
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19
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19376390--19376464
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24
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22
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1.96
19383015--19383173
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24
20
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5
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302
100
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6
2
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2.4
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2.2
24
96
0
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3
0
48
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19414347--19414455
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48
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27
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2.1
16
100
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17
11
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1.73
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228
1.9
228
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543
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21
30
24
1.99
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5.2
6
92
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55
15
15
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1
1
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19432918--19432974
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2.4
24
82
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1
3
31
1.22
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17
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1.96
19434696--19436315
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3.4
463
85
9
2113
33
22
16
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19436133--19436387
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1
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21
16
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3.0
12
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19451661--19451701
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100
0
82
68
0
0
31
0.90
19453681--19453712
15
2.2
15
94
5
57
68
3
0
28
1.04
19461193--19461225
14
2.3
15
89
5
50
39
0
3
57
1.14
19463171--19463218
17
2.7
18
70
9
53
60
2
0
37
1.09
19463185--19463241
29
2.0
29
85
0
78
57
3
1
36
1.26
19465432--19465507
22
3.5
21
83
5
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28
26
32
11
1.92
19470898--19470961
26
2.5
26
82
5
76
26
14
31
28
1.95
19477125--19477164
21
2.0
21
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5
64
40
2
22
35
1.68
19478699--19478872
45
3.9
45
84
3
194
25
28
21
23
1.99
19481925--19482017
43
2.2
44
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120
60
9
2
27
1.40
19482406--19482455
12
4.4
12
78
14
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64
0
4
32
1.12
19484202--19484617
45
9.2
45
64
15
153
27
26
14
31
1.95
19484157--19484699
90
6.0
90
90
0
798
27
26
14
31
1.95
19484264--19484665
45
8.9
45
64
16
172
27
26
15
31
1.95
19493126--19493204
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3.0
27
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1
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39
20
22
17
1.92
19493326--19493385
27
2.3
27
82
8
70
33
11
16
38
1.85
19500177--19500266
43
2.1
43
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8
114
54
10
2
33
1.46
19500200--19500291
43
2.2
42
81
14
109
58
9
2
29
1.42
19500688--19500746
21
2.9
21
82
9
61
64
1
3
30
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19506779--19506811
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1.9
18
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11
52
51
18
12
18
1.76
19507339--19507509
45
3.9
45
90
3
242
25
29
22
22
1.99
19510190--19510227
14
2.5
15
87
8
51
50
7
2
39
1.46
19510776--19510823
24
2.0
24
100
0
96
50
12
4
33
1.59
19524056--19524115
31
1.9
31
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50
0
13
36
1.42
19524935--19524994
23
2.7
23
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2
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31
21
18
28
1.97
19531040--19531099
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1.9
31
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6
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51
0
13
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1.41
19531956--19532024
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22
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23
24
20
31
1.98
19531965--19532043
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26
22
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1.96
19532897--19532930
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2.8
12
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0
50
32
23
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8
1.86
19535563--19535656
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2.0
47
95
0
170
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18
18
28
1.94
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15
2.0
15
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0
51
6
10
10
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19537468--19537620
43
3.6
43
79
11
134
30
18
20
30
1.96
19537515--19537620
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2.5
42
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10
135
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19
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1.96
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18
2.4
18
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0
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50
0
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27
1.50
19543627--19543670
12
3.7
12
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0
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50
0
22
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1.50
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16
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0
0
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1.00
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2.0
21
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0
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48
0
4
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1.23
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18
2.4
18
92
0
70
50
0
22
27
1.50
19551358--19551401
12
3.7
12
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0
61
50
0
22
27
1.50
19553372--19553507
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4.4
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17
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1.80
19555938--19555997
30
2.0
30
90
0
93
58
13
1
26
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19556919--19556962
20
2.2
20
84
8
54
29
2
2
65
1.16
19558433--19558497
29
2.2
29
100
0
130
21
41
21
15
1.90
19560527--19560789
40
6.7
40
87
6
317
25
22
26
25
2.00
19560527--19560822
80
3.8
80
81
9
270
26
21
27
25
2.00
19566624--19566691
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3.0
23
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2
0
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42
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28
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9
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1.83
19586006--19586050
23
2.0
23
91
4
74
37
4
17
40
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          369   370   371   372   373