Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  90  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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145
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0
3
33
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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25
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29
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2.9
51
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194
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29
30
1.81
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1.9
103
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1.9
20
89
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28
5
7
58
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28850427--28850769
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8.8
40
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24
29
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24
1.99
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1
509
24
29
21
24
1.99
28859109--28859421
122
2.6
120
92
1
509
24
29
21
24
1.99
28862552--28862815
23
11.5
23
84
4
309
31
24
20
23
1.98
28864165--28864190
7
3.7
7
100
0
52
57
0
0
42
0.98
28864491--28864538
19
2.7
18
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18
64
64
0
4
31
1.12
28864525--28864554
15
1.9
16
93
6
53
66
3
0
30
1.07
28864579--28864748
7
24.1
7
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18
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59
1
2
36
1.20
28864487--28864815
26
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25
65
24
99
60
1
3
34
1.22
28864487--28864815
18
17.6
19
63
25
66
60
1
3
34
1.22
28864688--28864811
12
10.6
12
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20
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63
0
1
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1.10
28864487--28864815
24
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25
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21
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60
1
3
34
1.22
28864682--28864755
30
2.7
27
82
15
89
63
0
0
36
0.95
28864682--28864815
49
2.7
48
74
16
128
62
0
1
35
1.10
28866350--28867302
205
4.6
205
91
0
1447
27
21
19
30
1.98
28875474--28875599
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3.2
40
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21
24
29
24
1.99
28875474--28875614
40
3.5
39
91
6
221
22
24
29
24
1.99
28876427--28876456
13
2.4
12
89
10
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90
0
10
0
0.47
28879192--28879364
46
3.7
46
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10
190
23
19
26
31
1.98
28879189--28879359
93
1.8
93
89
0
270
22
19
27
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28879589--28879626
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
28885445--28885503
18
3.2
19
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7
59
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1
1
32
1.13
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21
2.8
21
80
17
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57
0
5
36
1.21
28885748--28885815
16
3.9
18
80
17
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0
2
33
1.10
28885747--28885821
21
3.7
20
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20
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62
0
2
34
1.09
28885747--28885854
53
2.0
56
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0
4
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1.17
28885745--28886011
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20
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0
4
34
1.21
28885744--28886008
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24
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0
4
34
1.21
28885754--28886012
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19
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25
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0
4
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1.22
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1.9
99
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222
61
1
4
33
1.22
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12
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28
1.12
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2.5
19
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13
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0
2
36
1.08
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3.9
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246
33
6
31
28
1.82
28890397--28890608
51
4.1
50
82
7
248
35
6
30
27
1.82
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4.1
47
77
15
165
36
6
29
28
1.81
28892794--28892881
44
2.0
44
97
0
167
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21
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1.77
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39
2.0
40
89
7
122
44
11
12
31
1.79
28898882--28898907
9
2.9
9
100
0
52
69
11
0
19
1.18
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2.3
27
91
0
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1
18
4
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1.06
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1.9
37
91
0
117
22
33
20
23
1.97
28902251--28902356
48
2.2
48
93
0
176
33
27
5
33
1.80
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24
1.9
24
86
0
65
23
10
2
63
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28906826--28906902
39
2.0
39
97
0
145
44
12
11
31
1.79
28909531--28909748
40
5.5
40
89
4
318
23
22
28
25
1.99
28923727--28923787
24
2.5
24
86
5
79
34
29
16
19
1.94
28926516--28926576
30
2.0
30
90
0
95
29
24
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39
1.80
28939557--28939654
49
2.0
49
95
0
178
36
15
9
38
1.79
28940915--28941042
58
2.2
58
78
6
136
32
17
22
27
1.97
28944500--28944677
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
28944521--28944676
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1.9
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233
29
28
15
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1.96
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28
2.6
26
82
8
95
47
14
15
22
1.82
28968627--28968718
29
3.2
29
81
1
114
29
31
14
25
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373