Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  359  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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1.07
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22
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12
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.25
119142182--119142239
27
2.3
25
77
13
64
34
6
1
56
1.36
119142320--119142357
3
12.3
3
88
5
58
34
2
0
63
1.09
119142415--119142450
17
2.1
17
89
0
54
30
2
2
63
1.22
119142608--119142637
15
2.0
15
93
0
51
33
10
0
56
1.32
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3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
119145426--119145469
18
2.4
18
96
0
79
56
4
0
38
1.20
119161445--119161812
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126
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1
587
27
17
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38
1.91
119161888--119161935
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22
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50
18
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119161900--119161974
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22
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18
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40
1.59
119162041--119162082
22
1.9
22
100
0
84
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16
0
42
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34
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107
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41
18
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38
1.59
119162168--119162239
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18
2
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1.65
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119162202--119162263
22
2.8
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0
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0
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44
0
1
53
1.10
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12
4.5
12
81
16
69
44
0
1
53
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
10
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29
1.98
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2.2
19
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13
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50
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25
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2.1
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0
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0
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0
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105
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2.0
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0
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0
0
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2.7
25
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11
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39
0
3
57
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119257037--119257083
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53
0
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2.1
22
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0
2
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1.13
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11
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100
0
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0
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50
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2.0
21
90
0
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29
21
29
19
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373