Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  236  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80204005--80204181
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28
22
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.86
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4.5
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2
1059
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28
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1.86
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2.9
37
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1.97
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1.87
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5.1
47
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0
332
27
29
10
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80311063--80311137
23
3.2
23
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17
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34
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1
37
1.65
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26
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1.71
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40
8.7
40
87
6
502
22
26
20
30
1.98
80318172--80318353
91
2.0
91
100
0
364
21
26
20
30
1.98
80318099--80318433
171
2.0
171
93
0
571
22
26
20
30
1.98
80321878--80322020
72
2.0
72
95
2
261
40
6
16
35
1.76
80323050--80323103
21
2.6
21
80
16
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24
27
35
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80341503--80341575
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29
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32
30
10
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80341588--80341663
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40
88
0
116
34
30
15
19
1.93
80347288--80347415
40
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25
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24
2.00
80367409--80367440
15
2.1
15
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0
55
56
25
0
18
1.42
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10.9
50
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29
24
18
26
1.98
80371731--80372274
101
5.4
101
75
10
411
29
25
18
26
1.98
80371733--80372274
151
3.6
151
92
1
883
30
24
18
26
1.98
80375571--80375728
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42
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22
20
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29
1.99
80378162--80378254
46
2.0
46
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0
177
35
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26
23
1.98
80382772--80382899
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11
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28
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28
24
1.99
80393839--80393865
13
2.1
13
100
0
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37
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1.88
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27
2.1
27
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0
107
18
25
3
51
1.62
80406814--80406919
27
3.9
27
75
4
115
27
16
17
38
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80408650--80408783
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2.3
57
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24
20
20
34
1.97
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40
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40
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0
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19
26
22
1.98
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15
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15
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7
87
12
16
10
60
1.58
80422075--80422240
46
3.6
46
75
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174
22
19
27
29
1.98
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19
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0
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1.34
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349
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13
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1.84
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19
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47
0
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1.34
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241
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18
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1.98
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5
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0
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56
0
0
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27
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25
1.99
80446551--80446770
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25
27
20
25
1.99
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79
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9
276
25
26
22
25
2.00
80454515--80454737
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266
25
26
22
25
2.00
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2.1
16
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0
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24
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58
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154
25
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16
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1.96
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17
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17
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28
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22
2.0
23
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45
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13
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2
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0
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0
50
0
1.00
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37
2.1
36
88
2
111
24
32
19
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80489726--80490196
47
10.1
47
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1
741
28
30
9
31
1.88
80489726--80490196
93
5.0
94
93
1
750
28
30
9
31
1.88
80489726--80490196
140
3.4
141
92
1
750
28
30
9
31
1.88
80495163--80495311
43
3.5
42
76
7
131
34
25
16
23
1.96
80515278--80515386
37
2.9
37
93
0
173
27
29
19
23
1.98
80515532--80515670
52
2.8
49
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210
31
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80515708--80515785
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25
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0
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40
5.8
40
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0
401
24
28
22
25
2.00
80521519--80521627
37
2.9
37
93
0
173
27
29
19
23
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373