Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   

This is table  6  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1648478--1648618
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22
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0
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26
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2.6
29
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20
93
25
24
12
38
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1713224--1713257
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2.0
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0
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2.1
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4.1
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2.0
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2.3
26
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2
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2.0
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2.1
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2.3
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3.5
14
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5
62
76
0
8
14
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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162
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19
18
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2.0
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0
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2.0
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4
158
48
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27
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0
0
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0
0
38
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1.9
31
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42
13
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37
1.71
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16
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1.91
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1.93
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2.1
53
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6
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17
16
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1.86
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1853249--1853319
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1.47
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10
50
2
13
0
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1856851--1856907
25
2.2
25
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9
62
31
7
8
52
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1857354--1857403
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3.1
16
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52
32
0
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1858422--1858472
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1
3
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17
2.5
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20
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6
32
1.45
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2.0
30
81
9
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63
3
3
30
1.27
1861015--1861071
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18
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61
3
3
17
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1.09
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13.7
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995
33
19
15
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1.93
1861836--1862993
297
3.8
297
80
8
1182
33
19
15
30
1.94
1862772--1862946
91
2.0
87
86
6
244
33
20
18
27
1.96
1861903--1862993
311
3.6
308
81
7
939
33
20
15
30
1.94
1862861--1863130
68
3.9
73
75
19
256
30
24
16
28
1.97
1873296--1873340
11
3.9
11
80
11
54
60
4
0
35
1.17
1875939--1875991
26
2.0
26
82
7
63
26
15
20
37
1.92
1877482--1877565
26
3.2
26
94
0
141
35
25
5
33
1.80
1878906--1878936
15
2.1
15
93
0
53
32
9
0
58
1.31
1878925--1879004
27
2.9
27
76
12
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32
7
8
51
1.61
1879019--1879055
17
2.1
19
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10
60
32
0
5
62
1.18
1879224--1879280
21
2.7
21
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7
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29
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56
1.52
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26
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70
26
9
11
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1.68
1886355--1886470
55
2.1
55
100
0
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44
3
9
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1886558--1886617
3
20.0
3
100
0
120
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0
0
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29
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29
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35
8
0
55
1.32
1916238--1916274
5
7.2
5
96
3
65
56
0
0
43
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1923268--1923307
16
2.5
16
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0
53
47
5
0
47
1.24
1924742--1924770
13
2.1
14
93
6
51
0
10
0
89
0.48
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19
2.3
19
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15
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0
0
39
0.97
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12
3.9
12
81
13
51
60
0
0
39
0.97
1932736--1932780
14
3.3
15
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14
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60
0
0
40
0.97
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20
2.4
20
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16
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59
0
0
40
0.97
1932881--1932922
19
2.4
17
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11
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26
23
2
47
1.64
1939523--1939588
13
5.1
13
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26
2.0
26
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3
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5
0
31
1.19
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22
2.4
22
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9
0
19
1.13
1941999--1942046
21
2.3
20
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10
0
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15
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0
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0
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1.30
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20
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15
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0
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2.1
37
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0
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21
3.2
21
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25
27
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1.80
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25
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25
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29
27
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19
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20
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2.2
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5
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4
7
44
1.51
1976304--1976374
31
2.3
32
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1981563--1981641
39
2.0
39
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0
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13
2.2
13
100
0
56
60
0
0
39
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1983284--1983328
24
1.9
23
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4
63
71
0
2
26
0.98
1988829--1988881
26
2.0
25
82
13
63
37
0
0
62
0.96
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14
2.5
14
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0
52
62
11
5
20
1.48
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10.0
3
100
0
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0
0
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3
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3
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59
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0
0
32
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2.2
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43
1
2
52
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2000777--2000808
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16
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0
0
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0
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2019104--2019130
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3.4
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100
0
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77
0
0
22
0.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373