Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  41  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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1.97
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26
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18
18
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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19
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41
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5
51
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1
46
20
30
1.60
11964286--11964346
21
2.9
21
80
4
61
3
49
18
29
1.63
11964762--11964790
14
2.1
14
93
6
51
58
6
0
34
1.25
11969962--11970469
9
57.4
9
80
5
552
37
1
12
47
1.54
11969962--11970471
53
9.6
54
82
10
549
37
1
13
47
1.54
11969967--11970467
44
11.3
45
84
5
474
38
1
12
46
1.54
11970581--11970636
15
3.8
15
76
4
69
55
0
1
42
1.10
11970810--11970880
24
3.0
24
93
0
124
43
8
19
28
1.80
11970928--11971060
64
2.1
64
95
0
239
48
3
11
36
1.57
11974200--11974225
13
2.0
13
100
0
52
0
23
0
76
0.78
11976734--11976847
22
5.1
21
75
16
88
38
17
24
19
1.93
11976736--11976935
25
8.4
24
84
7
196
34
18
26
21
1.96
11976736--11976911
47
3.7
46
85
6
203
35
18
25
21
1.95
11980126--11980170
18
2.5
18
88
0
72
44
8
28
17
1.79
11980181--11980243
31
2.0
32
84
3
83
60
4
20
14
1.52
11980500--11980528
13
2.2
13
100
0
58
51
27
6
13
1.66
11987735--11987791
28
2.0
28
96
0
105
47
5
10
36
1.61
11989378--11989595
48
4.6
47
78
10
200
25
30
18
25
1.98
11995878--11995917
21
2.0
21
85
5
55
20
25
40
15
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11997192--11997310
45
2.5
47
77
13
120
26
27
17
28
1.98
11997230--11997400
94
1.8
91
85
6
236
23
28
18
29
1.98
12003947--12004001
27
2.0
27
96
0
101
32
10
34
21
1.89
12011048--12011080
5
6.6
5
92
0
57
21
0
0
78
0.75
12016964--12017013
26
1.9
26
88
8
75
58
2
32
8
1.39
12019102--12019129
13
2.2
13
100
0
56
53
21
0
25
1.46
12022118--12022186
30
2.3
31
82
7
79
47
20
10
21
1.79
12023939--12023999
28
2.2
28
96
0
113
19
14
13
52
1.74
12025409--12025460
26
2.0
26
100
0
104
34
26
7
30
1.85
12033410--12033491
26
3.2
26
96
0
146
35
24
7
32
1.83
12035179--12035209
3
10.3
3
100
0
62
67
0
32
0
0.91
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22
2.0
22
90
0
68
34
2
16
46
1.60
12046080--12046122
22
2.0
22
90
0
68
34
2
16
46
1.60
12046710--12046817
49
2.2
49
100
0
216
32
18
15
33
1.93
12067814--12067867
25
2.1
26
86
10
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62
1
3
31
1.23
12068500--12068531
14
2.2
15
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5
57
59
0
0
40
0.97
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16
2.2
15
89
5
50
55
0
0
44
0.99
12073185--12073302
33
3.6
33
77
6
116
30
22
13
33
1.92
12073156--12073302
32
4.5
33
76
5
111
27
23
13
35
1.92
12080547--12080655
33
3.3
33
78
6
123
34
22
11
32
1.89
12086559--12086696
57
2.4
58
83
11
169
28
16
22
31
1.96
12087218--12087279
29
2.1
29
93
0
106
33
12
17
35
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12088358--12088452
46
2.1
46
95
0
172
40
17
5
36
1.73
12088472--12088515
21
2.1
21
95
0
79
34
9
20
36
1.84
12089658--12089748
45
2.0
44
91
2
146
32
13
7
46
1.71
12090287--12090319
15
2.1
16
88
5
50
60
3
9
27
1.42
12094378--12094460
43
1.9
43
95
0
148
21
18
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27
1.96
12110280--12110404
43
2.9
43
86
3
155
20
17
32
29
1.96
12117167--12117208
21
2.0
21
85
4
57
50
7
26
16
1.71
12124469--12124590
35
3.5
35
88
2
183
27
13
24
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1.93
12126042--12126107
22
3.0
21
80
10
71
19
3
4
72
1.15
12127850--12128004
45
3.4
45
78
1
141
41
14
18
25
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          369   370   371   372   373