Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  354  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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0.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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22
21
20
1.96
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1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.0
29
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0
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19
14
17
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2.0
18
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27
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2.0
20
89
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38
2
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0
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15
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117753100--117753151
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0
5
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1.10
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3
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23
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0
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0
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1.40
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7
0
37
1.27
117769717--117769770
21
2.5
21
76
8
56
57
1
3
37
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2
0
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1.31
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0
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2.0
23
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0
2
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1.21
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1
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1.23
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0
0
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117798934--117798999
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18
3
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1.12
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24
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1.11
117798934--117799009
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25
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95
73
19
2
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0
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1.00
117799310--117799363
15
3.9
14
82
17
60
72
3
0
24
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117799743--117799772
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2.7
11
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0
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0
0
60
0.97
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12
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0
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1.77
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74
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2.0
301
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1
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2.5
24
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2
104
70
21
3
5
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373