Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   

This is table  63  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18991528--18991568
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6.5
6
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2
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0
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19002403--19002443
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0
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2.1
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25
28
18
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2.0
20
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0
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2.0
14
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0
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14
0
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50
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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0
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1.9
19
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1.39
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19
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2
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1.32
19065086--19065146
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0
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0
0
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3.0
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35
0
0
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42
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1.20
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33
5
14
45
1.69
19084177--19084324
37
4.0
37
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237
34
5
14
45
1.68
19084255--19084317
17
3.5
17
69
12
54
33
3
12
50
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19084323--19084406
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2.0
21
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31
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1.94
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92
0
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36
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2.1
14
100
0
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20
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20
20
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1.71
19093642--19093684
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20
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2
0
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18
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55
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20
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5.1
9
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0
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0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
19131504--19131574
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2
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18
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23
1.98
19141072--19141872
400
2.0
400
86
3
1121
30
22
16
30
1.96
19142826--19143048
79
2.8
79
84
9
269
24
27
22
26
2.00
19142826--19143048
39
5.7
40
86
8
266
24
27
22
26
2.00
19151015--19151276
39
6.7
40
86
7
310
25
27
21
25
2.00
19154256--19154375
28
4.3
28
89
2
170
34
26
10
28
1.90
19161683--19161849
88
1.9
88
91
1
271
35
16
22
24
1.95
19161679--19161924
89
2.8
89
83
1
278
34
15
23
26
1.95
19167982--19168064
25
3.3
25
96
0
157
25
22
19
32
1.97
19171984--19172168
40
4.7
40
82
6
216
25
27
22
24
2.00
19171989--19172168
79
2.3
80
80
9
208
24
27
23
24
2.00
19177748--19177792
23
2.0
23
91
8
74
15
26
22
35
1.94
19177860--19177910
23
2.2
23
86
6
68
15
19
21
43
1.88
19180443--19180505
23
2.7
23
90
0
99
19
23
20
36
1.95
19182346--19182572
48
4.8
48
76
9
216
27
19
24
28
1.98
19184303--19184526
84
2.7
84
97
0
430
30
4
23
41
1.75
19187357--19187558
90
2.2
90
88
0
296
36
15
24
24
1.94
19187357--19187605
90
2.8
90
83
2
268
36
15
22
24
1.94
19197010--19197051
19
2.3
19
91
4
68
66
0
33
0
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19198039--19198141
51
2.0
53
83
12
133
19
21
21
37
1.94
19198126--19198164
6
6.5
6
93
0
69
17
15
15
51
1.77
19198131--19198170
18
2.2
18
86
0
53
17
20
12
50
1.78
19197989--19198340
188
1.9
188
96
0
650
19
21
22
36
1.95
19203563--19203604
19
2.3
19
87
4
59
69
0
30
0
0.89
19204592--19204694
51
2.0
53
84
9
140
18
21
22
37
1.94
19204679--19204711
6
5.5
6
92
0
57
18
15
15
51
1.77
19204679--19204717
18
2.2
18
85
0
51
17
20
12
48
1.80
19204843--19204885
18
2.4
18
80
0
50
37
11
18
32
1.87
19206907--19206954
23
2.0
23
84
4
60
29
2
2
66
1.14
19208484--19208515
16
2.0
16
100
0
64
25
18
6
50
1.70
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40
5.7
40
90
1
303
26
27
23
22
1.99
19222627--19222756
47
2.8
47
84
4
172
30
28
16
24
1.97
19236406--19236437
14
2.4
13
90
10
55
18
6
12
62
1.50
19239991--19240122
47
2.8
47
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3
194
33
26
17
22
1.96
19244756--19244886
47
2.8
47
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3
183
33
25
14
25
1.94
19256002--19256201
51
3.9
51
90
1
285
30
25
13
31
1.93
19256224--19256426
28
7.7
27
79
13
226
25
22
15
36
1.93
19256265--19256415
24
6.0
24
81
11
185
23
21
16
39
1.92
19256240--19256426
52
3.6
52
95
0
320
25
21
15
37
1.92
19266691--19266723
16
2.0
17
88
5
50
21
27
12
39
1.88
19271274--19271383
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19277170--19277279
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
19280117--19280595
47
10.2
47
92
1
782
32
8
30
28
1.86
19284702--19284727
8
3.2
8
100
0
52
38
11
0
50
1.39
19289521--19289545
10
2.5
10
100
0
50
32
0
28
40
1.57
19289728--19289779
26
2.0
26
100
0
104
30
15
19
34
1.93
19293422--19293505
26
3.2
26
94
0
141
33
5
25
35
1.80
19295277--19295552
137
2.0
137
96
2
511
24
18
25
31
1.98
19300235--19300318
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3.2
26
94
0
141
34
4
23
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1.76
19302105--19302391
137
2.1
137
95
1
513
24
18
25
32
1.97
19304199--19304278
26
3.2
24
75
16
67
46
3
1
48
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          369   370   371   372   373