Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  181  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60689192--60689271
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29
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1.97
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1.96
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1.99
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211
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28
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1.97
60727672--60727826
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129
24
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2.3
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36
20
21
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.9
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1.95
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28
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54
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158
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15
28
28
1.96
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196
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1.96
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1.9
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224
26
15
28
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1.96
60796228--60796408
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2.2
81
82
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220
26
15
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22
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3.8
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17
17
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65
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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29
1.97
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100
2.3
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293
26
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1.97
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2.4
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1.98
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20
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15
25
16
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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28
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2.00
60883678--60883725
9
5.0
9
80
14
60
12
2
2
83
0.83
60883796--60883968
94
1.8
94
96
0
319
36
14
13
35
1.85
60884168--60884215
14
3.4
14
85
0
60
43
6
31
18
1.75
60889968--60890023
12
4.7
12
86
4
78
73
5
5
16
1.21
60889968--60890023
24
2.3
24
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0
94
73
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1.21
60890943--60890999
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5
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1
17
1
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60890947--60890995
27
1.9
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2
16
2
0.92
60891047--60891077
12
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12
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0
53
45
12
19
22
1.84
60893286--60893373
30
2.9
30
71
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28
27
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28
1.96
60895953--60895999
10
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1.06
60895952--60896000
11
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10
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19
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10
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79
1.03
60895952--60895988
19
1.9
19
100
0
74
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5
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0.99
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76
1.13
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0
0
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0
0
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30
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27
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1.96
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2.0
79
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21
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2
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30
3
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33
1.74
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40
4.9
40
90
2
276
24
22
26
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60919209--60919408
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5.0
39
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4
251
25
21
26
26
1.99
60921109--60921148
19
2.1
19
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0
53
25
35
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22
1.95
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13
4.6
13
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86
73
5
5
16
1.19
60926310--60926369
25
2.4
25
88
2
84
73
5
5
16
1.19
60927391--60927472
30
2.7
31
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2
19
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1.33
60929225--60929272
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1.97
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29
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1.97
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1.80
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107
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40
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1.82
60940504--60940878
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1.81
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1.84
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27
6.2
27
88
0
244
34
19
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24
1.97
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22
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20
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1.96
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24
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1.95
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4.5
31
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0
212
18
16
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15
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18
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16
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12
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2.1
14
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51
6
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10
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3.2
65
78
8
208
23
28
16
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60965714--60965774
30
2.0
30
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0
86
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39
1.80
60972622--60972678
11
5.5
10
73
22
55
77
1
17
3
1.00
60972622--60972678
5
11.0
5
77
17
55
77
1
17
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1.00
60972622--60972678
16
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14
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17
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1.00
60972726--60972757
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0
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1.30
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2.0
17
88
11
52
47
14
11
26
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373