Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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9
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1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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189
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19
14
26
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.98
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2.3
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2721054--2721096
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6
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2
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0
13
0
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0.58
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14
0
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1.39
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13
21
21
1.87
2726777--2727217
127
3.4
129
84
4
559
40
19
15
24
1.90
2729215--2729689
132
3.6
132
77
10
448
29
20
18
31
1.96
2729521--2729776
89
2.9
89
87
1
354
31
19
17
31
1.95
2729801--2729991
100
1.9
100
95
0
346
25
20
19
34
1.96
2730077--2730208
64
2.1
63
85
5
185
33
16
19
30
1.94
2741398--2741800
128
3.1
129
88
3
562
41
19
14
24
1.89
2745405--2745438
15
2.3
15
89
0
50
52
8
0
38
1.33
2747959--2748059
31
3.3
30
76
14
73
39
1
1
56
1.22
2753634--2753658
12
2.1
12
100
0
50
44
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0
1.47
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16
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15
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33
0
2
64
1.08
2753878--2753939
27
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27
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0
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33
3
8
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1.46
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19
2.0
18
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78
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5
1.08
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18
1.9
18
88
0
52
11
2
5
80
1.00
2762377--2762438
29
2.1
29
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3
88
29
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11
46
1.77
2770984--2771042
24
2.4
24
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8
75
55
6
1
35
1.36
2775952--2775991
21
2.0
20
85
5
53
50
10
37
2
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
2.9
18
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17
60
38
1
5
54
1.34
2778053--2778101
19
2.5
19
87
9
64
32
2
6
59
1.34
2788263--2788299
12
3.0
13
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11
51
29
40
18
10
1.85
2790745--2790782
19
2.0
19
85
10
51
36
0
0
63
0.95
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28
2.0
29
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50
10
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22
1.74
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29
1.9
29
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7
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26
21
25
26
1.99
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29
2.2
28
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10
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26
20
26
26
1.99
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22
2.5
22
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1.80
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30
2.1
30
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85
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1
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1.24
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2
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0
0
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11
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53
57
0
0
42
0.98
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26
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78
58
0
4
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1.20
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2.0
29
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3
4
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1.32
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2.0
30
100
0
120
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0
0
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2.0
15
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0
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0
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18
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0
0
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0
0
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16
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0
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18
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2
26
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2
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2
100
0
88
0
50
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2829284--2829346
30
2.1
30
84
3
81
38
3
7
50
1.47
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22
2.0
22
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0
59
58
9
11
20
1.61
2832107--2832147
11
3.7
11
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0
55
56
7
14
21
1.63
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2.1
18
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0
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23
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0
0
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0
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0
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0
0
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2.0
30
96
0
113
27
24
21
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373