Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  263  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
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Score
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28
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23
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24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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4.2
28
85
2
155
18
25
21
35
1.95
89591176--89591213
18
2.1
18
100
0
76
39
10
5
44
1.61
89599197--89599321
44
2.8
44
75
16
112
30
25
17
26
1.97
89599337--89599460
46
2.7
45
79
8
144
22
26
20
30
1.98
89600125--89600164
20
2.0
21
85
5
55
37
20
0
42
1.52
89604948--89605130
79
2.3
81
82
7
214
24
22
27
25
2.00
89604948--89605132
40
4.7
40
84
6
216
24
22
27
25
2.00
89605001--89605155
79
2.0
79
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7
190
25
20
27
26
1.99
89608180--89608388
67
3.2
65
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11
194
30
16
29
23
1.96
89608204--89608388
67
2.9
64
77
8
196
28
16
30
24
1.96
89611704--89611934
48
4.9
48
74
11
206
26
24
19
29
1.99
89616773--89617033
47
5.6
47
74
12
182
24
29
19
26
1.99
89616773--89617033
94
2.8
91
77
11
269
24
29
19
26
1.99
89625415--89625563
31
4.8
31
93
0
235
26
20
29
24
1.99
89625588--89625711
47
2.7
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2
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28
16
26
29
1.97
89625682--89625796
42
2.7
43
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6
155
30
14
26
28
1.95
89625968--89626020
26
2.0
26
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0
97
33
13
11
41
1.80
89627236--89627544
47
6.7
45
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15
195
23
28
20
27
1.99
89627186--89627541
94
3.8
93
78
11
320
23
28
19
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89627891--89628001
30
3.7
30
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2
206
33
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10
28
1.90
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18
1.9
18
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0
52
54
0
2
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1.15
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10
3.8
11
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12
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34
0
0
65
0.93
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19
2.3
19
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0
52
11
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0
52
1.38
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19
2.0
19
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0
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13
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0
55
1.38
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13
2.2
13
100
0
58
55
13
0
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1.39
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1.9
18
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0
52
54
0
2
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1.15
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1.9
19
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0
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1.40
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1.97
89663686--89663754
23
2.9
24
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6
77
20
24
20
34
1.96
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4.4
16
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77
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1.11
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23
2.0
23
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0
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42
19
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34
1.70
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20
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48
7
0
43
1.31
89685368--89685401
7
4.9
7
100
0
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29
29
0
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1.57
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58
2.3
58
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0
201
27
25
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15
2.1
15
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0
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1.79
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2.4
16
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0
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0
28
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1.02
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2.0
19
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26
0
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32
2.0
32
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6
83
41
9
1
47
1.45
89722373--89722420
17
2.9
17
84
6
64
41
8
2
47
1.45
89722925--89722974
23
2.1
23
85
3
64
72
8
2
18
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89739547--89739637
30
2.9
32
80
6
114
35
9
12
42
1.75
89748551--89748715
77
2.1
77
81
6
183
23
17
20
38
1.93
89749125--89749226
46
2.2
46
100
0
204
20
5
27
46
1.74
89750536--89750681
73
2.0
73
97
0
274
31
23
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28
1.96
89752868--89752894
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2.1
13
100
0
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37
22
0
40
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100
0
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0
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1
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120
27
25
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29
1.97
89783005--89783029
13
1.9
13
100
0
50
48
8
0
44
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373