Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   

This is table  68  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20697410--20697638
98
2.4
97
83
5
277
27
19
28
24
1.99
20699399--20699504
28
3.8
28
81
9
110
30
33
10
26
1.90
20717374--20717424
3
16.7
3
95
4
93
66
0
0
33
0.92
20720252--20720317
31
2.1
31
91
0
105
53
19
9
18
1.71
20721190--20721227
19
2.1
19
85
9
53
50
0
7
42
1.31
20725962--20726031
9
8.0
9
76
9
65
35
0
17
47
1.48
20725966--20726040
34
2.2
34
83
4
89
34
1
16
48
1.54
20726166--20726324
9
17.7
9
67
19
91
35
3
15
45
1.62
20726204--20726265
16
3.8
16
93
4
97
33
1
17
46
1.58
20726166--20726316
80
1.9
80
91
0
248
35
3
15
45
1.63
20726201--20726324
25
4.7
26
73
14
94
36
3
16
44
1.64
20726432--20726696
98
2.7
99
97
1
498
51
3
6
38
1.45
20726618--20726810
62
3.2
60
74
16
202
57
2
5
35
1.33
20726677--20726720
19
2.4
19
96
3
81
68
0
0
31
0.90
20726578--20726810
118
2.0
118
92
3
389
54
2
5
36
1.37
20726578--20726758
56
3.1
56
74
14
195
54
2
5
37
1.38
20732021--20732052
15
2.1
15
94
0
55
28
6
0
65
1.16
20732920--20733073
41
3.8
41
69
11
120
25
20
22
31
1.98
20732881--20733053
81
2.1
81
84
6
217
24
20
21
32
1.98
20732881--20733073
81
2.4
80
78
11
189
26
21
21
30
1.98
20738350--20738398
16
3.3
16
72
21
61
34
2
8
55
1.41
20738343--20738402
28
2.1
28
100
0
120
43
3
6
46
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20739005--20739056
21
2.4
21
81
9
61
48
25
7
19
1.75
20741049--20741146
27
3.5
28
90
2
135
26
13
28
31
1.94
20741077--20741159
27
3.0
27
87
5
96
30
12
25
32
1.92
20741049--20741160
28
4.0
27
83
6
98
28
12
25
33
1.92
20748358--20748455
27
3.5
28
90
2
135
26
13
28
31
1.94
20748386--20748468
27
3.0
27
87
5
96
30
12
25
32
1.92
20748358--20748469
28
4.0
27
83
6
98
28
12
25
33
1.92
20753994--20754038
22
2.0
22
100
0
90
22
22
8
46
1.79
20757764--20757851
40
2.2
40
79
0
95
30
17
23
28
1.97
20762709--20762738
14
2.1
14
93
0
51
63
6
16
13
1.50
20782416--20782586
93
1.8
93
93
0
297
28
28
21
21
1.98
20782411--20782582
46
3.7
46
78
13
199
29
27
20
22
1.99
20783006--20783063
30
1.9
30
89
0
89
27
27
8
36
1.86
20783906--20783980
29
2.6
29
83
6
107
42
18
12
26
1.85
20784796--20784886
42
2.1
42
81
2
101
23
23
25
28
1.99
20792587--20792757
93
1.8
93
92
0
288
28
30
19
21
1.98
20792578--20792747
46
3.7
45
77
10
191
28
30
20
21
1.98
20794061--20794155
41
2.3
41
76
3
102
31
27
22
18
1.97
20795008--20795113
30
3.5
30
92
0
176
12
29
39
18
1.87
20795049--20795100
17
3.3
17
71
20
58
11
28
40
19
1.86
20796155--20796244
33
2.8
32
75
12
94
33
23
10
33
1.88
20796959--20797000
20
2.0
21
86
13
61
33
16
0
50
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20803478--20803545
33
2.1
33
86
8
95
33
20
10
35
1.87
20813152--20813234
28
3.0
28
80
1
87
38
14
18
28
1.90
20816212--20816809
49
12.1
49
86
9
815
32
8
29
29
1.87
20816212--20816643
96
4.5
96
95
3
769
32
8
28
29
1.87
20816625--20816659
16
2.2
16
100
0
70
37
0
25
37
1.57
20816529--20816758
112
2.1
112
98
0
442
33
6
29
30
1.83
20816641--20816809
47
3.6
47
86
3
212
32
8
30
28
1.86
20816576--20816705
63
2.0
64
94
2
226
34
5
27
32
1.80
20816928--20817006
37
2.1
37
90
0
122
24
18
31
25
1.98
20818905--20818978
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
20819294--20819434
39
3.5
40
79
10
146
26
22
28
22
1.99
20819409--20819685
40
6.9
40
89
0
392
25
21
27
25
2.00
20823123--20823845
47
15.1
47
92
3
1167
32
9
29
28
1.88
20823123--20823845
96
7.5
96
92
3
1165
32
9
29
28
1.88
20823123--20823845
143
5.0
143
95
1
1275
32
9
29
28
1.88
20823964--20824042
37
2.1
37
90
0
122
24
18
31
25
1.98
20832462--20832521
24
2.5
24
94
2
104
53
5
13
28
1.60
20834556--20834580
13
1.9
13
100
0
50
20
8
32
40
1.81
20835607--20835647
21
1.9
22
85
5
57
34
24
2
39
1.69
20839996--20840059
31
2.1
31
90
0
101
25
23
14
37
1.92
20840254--20840394
24
5.9
24
88
5
207
28
21
21
28
1.99
20840274--20840394
47
2.6
47
95
0
215
29
19
21
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20840274--20840393
23
5.1
23
91
3
195
30
20
21
28
1.98
20840446--20840510
20
3.2
20
93
0
112
32
21
12
33
1.90
20840446--20840499
11
5.3
11
70
17
53
31
20
12
35
1.90
20845821--20845874
13
4.2
13
80
0
63
33
20
1
44
1.62
20845821--20845874
26
2.1
26
89
0
81
33
20
1
44
1.62
20847366--20847428
29
2.1
30
88
2
92
23
3
15
57
1.53
20864734--20864840
42
2.5
43
77
4
119
27
18
23
30
1.98
20864694--20864856
43
3.8
42
73
9
159
25
18
25
30
1.98
20866198--20866240
20
2.2
20
91
0
68
37
18
9
34
1.83
20866416--20866441
7
3.7
7
100
0
52
57
0
0
42
0.98
20869473--20869517
24
1.9
23
86
13
65
53
8
0
37
1.32
20871713--20871769
22
2.6
23
72
10
57
49
1
3
45
1.29
20875685--20875726
17
2.4
17
88
4
57
59
0
2
38
1.10
20875795--20875852
29
2.0
29
100
0
116
55
6
3
34
1.44
20880937--20880969
9
3.7
9
91
0
57
39
12
18
30
1.87
20880937--20880971
18
1.9
18
100
0
70
40
11
17
31
1.85
20881284--20881316
12
2.8
12
90
0
57
24
18
0
57
1.40
20884759--20884979
66
3.4
65
76
5
194
42
6
4
46
1.49
20888951--20889036
42
2.0
41
86
8
118
40
4
4
50
1.44
20888971--20889032
21
3.0
20
71
17
63
41
4
3
50
1.40
20895441--20895544
23
4.5
23
76
8
104
36
19
23
21
1.95
20896435--20896555
62
2.0
62
100
0
242
32
8
8
51
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20900478--20900574
40
2.4
41
86
6
128
26
16
27
28
1.97
20911203--20911296
43
2.2
42
83
7
109
26
12
25
35
1.92
20917524--20917634
55
2.0
55
84
3
143
26
23
30
19
1.98
20924379--20924471
40
2.3
40
86
0
132
25
15
25
33
1.95
20925524--20925555
12
2.7
12
100
0
64
25
40
28
6
1.79
20928075--20928161
41
2.1
41
97
2
167
27
31
9
32
1.88
20939085--20939163
37
2.1
37
90
0
122
25
31
18
24
1.98
20939282--20939814
47
11.1
47
90
3
796
28
29
9
32
1.88
20939293--20939814
145
3.6
146
92
2
824
28
29
9
32
1.88
20939282--20939814
194
2.8
193
92
2
874
28
29
9
32
1.88
20944403--20944492
45
2.0
44
89
6
137
35
24
12
27
1.91
20947049--20947093
22
2.1
21
83
4
54
13
26
2
57
1.48
20954268--20954452
40
4.7
40
81
10
195
25
22
27
24
2.00
20954268--20954452
79
2.3
81
83
9
229
25
22
27
24
2.00
20954269--20954485
79
2.7
78
79
11
228
27
21
27
23
1.99
20962120--20962304
40
4.7
40
81
10
195
25
22
27
24
2.00
20962120--20962304
79
2.3
81
83
9
229
25
22
27
24
2.00
20962121--20962337
79
2.7
78
79
11
228
27
21
27
23
1.99
20974485--20974669
40
4.7
40
81
10
195
25
22
27
24
2.00
20974485--20974669
79
2.3
81
83
9
229
25
22
27
24
2.00
20974486--20974702
79
2.7
78
79
11
228
27
21
27
23
1.99
20997601--20997699
28
3.5
28
73
10
103
30
30
17
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20997574--20997700
56
2.3
56
92
0
218
29
33
17
19
1.95
20997683--20997737
25
2.2
25
87
6
76
25
32
12
29
1.93
20997856--20997990
43
3.1
43
88
0
180
34
31
20
14
1.92
20997987--20998147
40
4.0
40
91
0
241
26
29
23
19
1.98
21002780--21002874
28
3.4
28
71
11
95
32
28
17
21
1.96
21002749--21002871
56
2.2
56
89
0
183
30
30
17
21
1.96
21002858--21002912
25
2.2
25
87
6
76
25
32
12
29
1.93
21003031--21003147
43
2.7
43
86
0
153
35
29
22
12
1.91
21003043--21003170
43
3.0
43
87
0
166
35
31
21
12
1.90
21003162--21003322
40
4.0
40
93
0
268
27
31
22
19
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373