Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  52  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15411006--15411046
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4.5
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20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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84
11
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42
20
4
32
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15512793--15512847
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26
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25
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1.99
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
12
44
15
1.83
15604149--15604213
25
2.5
26
78
14
73
0
26
0
73
0.83
15604149--15604213
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2.8
22
81
13
69
0
26
0
73
0.83
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18
2.4
19
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2
0
34
1.06
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1
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21
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22
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35
1.54
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2.0
22
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0
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21
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25
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29
1.98
15632732--15632847
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2.3
50
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130
27
25
18
28
1.98
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1.9
157
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4
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1.82
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135
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1
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30
19
22
27
1.98
15685175--15685227
25
2.1
26
85
3
72
52
24
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13
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
0
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1
8
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0
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0
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1.98
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21
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0
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0
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45
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8
141
35
22
14
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15774411--15774541
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2.8
46
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2
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53
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0
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46
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0
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0
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6.1
47
91
0
410
25
29
11
33
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373