Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  290  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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98498385--98498433
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0
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60
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5
31
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1
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0
72
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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462
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0
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20
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29
1.98
98579143--98579318
46
3.8
46
77
10
178
22
19
27
30
1.98
98579140--98579310
93
1.8
93
88
0
261
22
19
27
29
1.98
98583527--98583858
164
2.0
164
93
2
569
37
13
20
28
1.91
98586991--98587139
41
3.6
40
82
5
156
29
17
24
28
1.97
98587030--98587139
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2.7
41
86
1
157
29
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24
27
1.98
98589136--98589173
14
2.9
13
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11
51
18
13
10
57
1.63
98592689--98592731
4
10.2
4
85
9
52
48
0
2
48
1.14
98599205--98599270
30
2.2
30
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0
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10
3
43
1.54
98603488--98603571
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12
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13
23
1.90
98610255--98610300
21
2.0
24
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12
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39
8
4
47
1.54
98615755--98615791
19
1.9
19
88
0
56
32
16
0
51
1.45
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2.0
20
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51
1.40
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2
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2
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0
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0
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0
1.00
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60
0
0
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0.97
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32
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5
89
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0
4
50
1.22
98623523--98623574
19
2.8
19
85
2
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71
1
0
26
0.97
98625645--98625670
13
2.0
13
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0
52
38
7
23
30
1.83
98633099--98633184
21
3.9
23
80
10
90
37
25
22
15
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98633555--98633612
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3.8
15
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2
89
51
12
0
36
1.39
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21
2.1
21
91
4
72
6
18
6
68
1.35
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5
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5
100
0
64
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0
0
40
0.97
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29
2.3
30
79
12
75
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4
10
32
1.57
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17
2.1
18
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14
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2
10
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98637259--98637523
3
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3
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60
6
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26
1.48
98638791--98638918
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42
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2
204
27
23
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1.98
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22
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1.96
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2.1
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1.37
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17.8
6
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49
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20
1.79
98660444--98660550
30
3.6
30
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180
49
14
15
20
1.79
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3.1
26
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5
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37
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21
19
1.94
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7.3
27
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0
248
27
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2
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27
1.85
98667192--98667252
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2.8
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14
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14
1.94
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72
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1.95
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15
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51
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0
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0
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59
0
0
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47
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1
985
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8
30
28
1.88
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2.1
37
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0
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25
1.98
98679763--98679797
17
2.1
17
94
0
61
37
31
11
20
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98679910--98679950
17
2.4
17
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8
57
36
0
17
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1.48
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2.1
39
100
0
160
26
7
22
43
1.79
98693107--98693153
24
2.0
24
91
0
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21
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1.60
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32
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12
122
28
23
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30
1.96
98693155--98693488
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3.3
101
88
1
510
28
23
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1.96
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4
100
0
50
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0
0
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0.80
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54
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0
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176
24
30
16
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1.96
98728486--98728602
33
3.6
33
83
3
139
28
27
14
29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373