Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   

This is table  4  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1009811--1010077
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0
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2.1
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31
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2.0
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52
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18
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0
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58
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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275
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2.0
82
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2.0
21
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2.0
33
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40
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58
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2.4
30
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36
0
11
52
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
5
36
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4.5
19
79
8
79
56
1
4
38
1.27
1195489--1195577
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9.0
10
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20
53
56
1
4
38
1.27
1195478--1195586
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39
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8
114
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1
5
38
1.35
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25
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19
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0
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0
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1241507--1241531
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2.8
9
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0
50
20
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24
48
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1244444--1244482
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2.6
15
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62
53
5
0
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1.23
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15
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3
60
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0
0
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18
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0
51
56
2
2
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1.27
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174
100
0
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12
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1.87
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2.0
22
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0
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2.0
24
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0
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12
8
41
1.73
1258927--1258951
3
8.3
3
100
0
50
36
0
0
64
0.94
1264784--1264820
16
2.4
16
86
13
51
64
0
0
35
0.94
1266756--1266801
3
15.3
3
95
0
83
34
2
0
63
1.07
1269077--1269145
16
4.2
16
96
3
129
24
0
37
37
1.56
1269077--1269145
33
2.1
32
97
2
129
24
0
37
37
1.56
1269126--1269216
45
2.0
45
85
2
121
27
6
28
37
1.82
1269381--1269415
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
1269501--1269535
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
1269364--1269589
120
1.9
120
99
0
443
48
5
1
44
1.35
1269692--1269724
14
2.3
15
89
5
50
75
6
0
18
1.00
1270068--1270206
59
2.4
58
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2
197
36
21
18
23
1.95
1274020--1274079
26
2.3
25
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11
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43
0
5
51
1.23
1278407--1278436
13
2.2
14
94
5
53
36
3
0
60
1.14
1283283--1283484
84
2.4
84
100
0
404
19
11
21
47
1.81
1316166--1316218
21
2.6
20
73
8
54
54
0
0
45
0.99
1316116--1316285
89
1.9
89
84
7
229
47
1
2
48
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
2.9
12
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13
52
33
0
0
66
0.92
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30
2.0
30
87
3
86
55
11
6
26
1.60
1322389--1322431
22
2.0
22
85
0
59
58
11
11
18
1.63
1322396--1322436
11
3.7
11
80
0
55
56
9
14
19
1.66
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2.6
43
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0
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29
32
26
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1.92
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38
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38
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1
582
29
25
23
20
1.99
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13
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13
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9
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28
0
9
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1.27
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20
2.4
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2
0
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1.11
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20
4.3
21
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16
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12
1
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1.48
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42
2.0
42
100
0
170
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2
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1.56
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23
3.3
23
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21
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31
13
1
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2.0
27
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0
90
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2.1
27
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1
0
40
1.08
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22
2.2
22
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0
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2
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19
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31
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5.5
92
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22
23
13
40
1.90
1350452--1350954
46
10.9
46
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0
729
22
23
13
40
1.90
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30
2.5
31
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4
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61
3
0
35
1.15
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7
3.7
7
100
0
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0
0
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0.89
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16
2.2
16
89
5
52
23
11
2
61
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1373390--1373423
16
2.1
17
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5
52
41
2
11
44
1.56
1380758--1380792
12
2.9
12
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0
52
20
0
60
20
1.37
1380758--1380792
18
1.9
18
88
0
52
20
0
60
20
1.37
1381321--1381503
86
2.1
86
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4
226
38
8
10
42
1.70
1382371--1382414
20
2.2
20
87
0
61
38
2
0
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1.10
1382849--1382922
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2.0
37
100
0
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2.2
21
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10
10
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14
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0
0
30
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2.0
22
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38
11
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1.62
1391678--1391719
20
2.2
20
87
12
61
26
0
4
69
1.08

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373