Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  325  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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Indices
Period
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Copy
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Score
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2.0
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1.98
Indices
Period
Size
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Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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45
1.83
109354166--109354215
17
2.9
18
76
11
59
72
6
6
16
1.25
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21
2.6
22
80
2
71
26
28
15
29
1.96
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43
2.7
43
81
0
138
31
21
17
29
1.96
109358397--109358530
66
2.0
66
82
2
162
13
21
20
44
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109363044--109363110
21
3.2
20
74
4
53
16
23
37
22
1.94
109363031--109363110
42
1.9
42
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0
124
16
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109363032--109363120
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0
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16
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23
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2.8
130
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29
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18
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3.5
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27
19
18
34
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0
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2.5
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2.4
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10
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28
2.2
28
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0
6
30
1.20
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61
2.0
61
93
0
206
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15
20
19
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
37
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26
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39
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2.3
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0
0
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1.73
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22
0
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0
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2.7
21
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5
58
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0
35
0
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9.1
145
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1722
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2.7
13
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0
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0
20
0.90
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0
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0
80
0.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373