Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  300  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101549220--101549303
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132
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21
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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177
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2.2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
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Score
A
C
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(0-2)
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2.1
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0
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19
25
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101744642--101744872
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2.1
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75
54
1
7
36
1.38
101756032--101756061
14
2.1
14
93
0
51
20
40
13
26
1.89
101756046--101756284
44
5.4
43
72
11
142
25
23
19
31
1.98
101756272--101756298
14
1.9
14
100
0
54
22
44
11
22
1.84
101756283--101756454
45
3.8
44
82
6
168
26
21
18
33
1.97
101756136--101756407
147
1.9
147
93
0
472
25
24
19
29
1.99
101776884--101776929
14
3.1
14
85
11
65
34
6
23
34
1.81
101776887--101776943
30
2.0
28
83
16
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29
5
28
36
1.79
101778882--101778922
21
2.0
21
85
0
55
29
29
29
12
1.93
101779783--101780054
47
5.8
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74
11
214
23
29
19
27
1.98
101779833--101780048
46
4.6
47
75
16
173
23
29
19
28
1.98
101784956--101784986
7
4.4
7
91
0
53
16
0
35
48
1.46
101785147--101785206
26
2.4
24
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8
75
68
1
0
30
0.99
101785177--101785235
21
2.8
22
85
7
70
69
6
0
23
1.12
101785282--101785314
15
2.1
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0
0
30
0.88
101786292--101786320
12
2.3
13
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5
51
37
0
0
62
0.96
101786914--101786980
14
4.7
15
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7
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38
5
16
38
1.73
101786914--101786980
29
2.3
29
89
2
100
38
5
16
38
1.73
101787191--101787226
18
1.9
19
88
5
56
52
0
0
47
1.00
101787443--101787528
22
4.0
22
70
13
79
44
20
5
29
1.75
101788473--101788533
32
1.9
32
89
0
95
50
18
3
27
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101788506--101788560
27
2.0
27
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6
76
52
18
3
25
1.61
101796326--101796358
17
2.0
17
88
5
50
45
0
6
48
1.27
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23
2.1
23
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62
60
4
2
33
1.27
101802869--101802909
19
2.2
18
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12
57
24
2
4
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1.22
101807479--101807524
24
1.9
24
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0
74
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21
23
1.80
101811461--101811502
22
1.9
22
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33
0
4
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1.17
101812748--101812812
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1.87
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0
7
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101817920--101817960
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13
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0
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1.24
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12
18
34
1.88
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21
2.1
22
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0
58
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2.4
21
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52
37
9
0
52
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101831412--101831611
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1.9
108
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275
38
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19
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1.81
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22
2.1
22
100
0
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0
4
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19
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30
1.61
101837677--101837723
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0
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1.13
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37
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23
28
1.99
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17
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0
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0
4
16
0.90
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0
2
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1.00
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126
2.5
126
92
0
519
39
15
18
25
1.90
101854720--101854762
22
2.0
21
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4
67
1.28
101856149--101856198
11
4.6
10
82
9
55
42
0
30
28
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101856149--101856198
21
2.3
21
80
16
57
42
0
30
28
1.56
101859938--101859991
18
2.9
19
77
5
65
42
7
14
35
1.74
101862072--101862108
19
1.9
19
88
0
56
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101874850--101875228
40
9.5
40
85
5
475
23
22
27
26
1.99
101874850--101875230
121
3.2
121
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3
567
23
22
27
26
1.99
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29
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0
177
37
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1.92
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29
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0
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0
1.00
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17
2.0
17
100
0
68
41
11
23
23
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373