Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  15  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4341631--4341717
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0
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21
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83
20
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2.2
20
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54
18
15
9
56
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.7
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2.0
170
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16
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2.0
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0
100
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2.0
27
100
0
110
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10
20
43
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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16
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53
1.44
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2.0
23
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4
54
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2
27
40
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2.1
35
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5
85
32
1
21
43
1.61
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1
19
45
1.60
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3.5
126
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18
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1.92
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26
2.0
25
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68
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0
44
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4498929--4499024
44
2.1
46
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5
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28
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9
0
36
1.32
4507555--4507613
28
2.1
28
96
0
109
49
0
23
27
1.51
4514281--4514362
42
2.0
42
85
0
110
30
10
21
36
1.88
4519132--4519164
7
4.7
7
88
11
50
0
69
0
30
0.88
4532474--4532524
14
3.7
14
75
12
52
49
5
3
41
1.45
4532506--4532538
14
2.4
14
90
5
50
54
0
3
42
1.15
4532819--4532866
22
2.3
21
86
13
64
66
0
4
29
1.10
4533037--4533083
19
2.3
22
75
17
55
34
4
0
61
1.15
4533291--4533351
30
2.1
29
82
14
74
27
1
1
68
1.08
4534118--4534195
28
2.7
30
88
9
117
24
5
20
50
1.68
4534118--4534194
30
2.7
27
90
8
109
23
5
20
50
1.68
4534897--4534939
16
2.8
15
86
6
59
30
6
0
62
1.21
4535043--4535074
16
2.0
16
93
0
55
21
21
6
50
1.71
4535074--4535202
3
42.7
3
73
13
86
34
6
1
57
1.33
4535165--4535225
9
6.8
9
82
0
50
31
6
1
60
1.32
4535164--4535248
12
7.0
13
80
7
65
31
5
1
61
1.28
4535294--4535354
22
2.8
22
80
2
61
18
6
6
68
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4550784--4550948
85
1.9
85
97
0
312
35
18
24
21
1.95
4551734--4552460
205
3.5
205
97
0
1346
30
17
22
29
1.97
4552351--4552546
87
2.3
87
94
0
338
32
15
22
29
1.95
4552146--4552752
292
2.1
292
94
0
1052
31
16
22
29
1.96
4551941--4552928
497
2.0
497
95
0
1796
30
17
22
29
1.97
4552438--4553326
403
2.2
406
89
2
1349
31
17
21
29
1.96
4552438--4553326
205
4.4
205
91
3
1334
31
17
21
29
1.96
4553584--4553709
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2.9
44
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3
148
32
15
23
27
1.95
4553466--4553702
132
1.8
131
82
2
305
32
16
24
26
1.96
4554162--4554223
27
2.3
27
91
2
97
22
4
19
53
1.64
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3
12.0
3
100
0
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0
0
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0.92
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16
2.8
15
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6
59
30
6
0
62
1.21
4555090--4555121
16
2.0
16
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0
55
21
21
6
50
1.71
4555312--4555372
22
2.8
22
80
2
61
18
6
6
68
1.33
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16
3.4
16
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12
7
21
58
1.57
4566022--4566086
33
1.9
34
87
3
96
16
7
21
53
1.68
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13
2.6
13
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9
52
35
0
0
64
0.94
4567655--4567711
24
2.4
24
78
0
69
40
14
14
31
1.85
4572827--4572865
16
2.5
15
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4
51
51
5
0
43
1.24
4580233--4580288
16
3.5
16
85
4
78
35
5
28
30
1.80
4580270--4580363
44
2.1
46
88
4
138
32
5
26
35
1.79
4580450--4580569
58
2.1
58
82
3
143
49
2
2
45
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4583642--4583706
33
2.0
33
93
0
112
47
10
30
10
1.73
4588124--4588162
20
2.0
20
84
0
51
64
0
0
35
0.94
4588368--4588419
16
3.2
16
83
0
59
28
19
5
46
1.73
4588378--4588434
16
3.6
15
81
9
60
28
17
3
50
1.62
4594494--4594549
21
2.8
20
76
10
60
62
0
3
33
1.12
4595627--4595696
29
2.5
28
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11
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2
2
35
1.28
4595618--4595690
37
2.0
37
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103
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2
2
34
1.25
4596060--4596107
19
2.5
20
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3
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37
4
0
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4596060--4596108
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10
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4
0
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1.17
4598599--4598636
18
2.1
18
100
0
76
31
0
18
50
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373